數(shù)據(jù)分析時我們經(jīng)常會遇到多組treatment和control,多個細(xì)胞系,多種組學(xué)數(shù)據(jù)類型的情況,用ggplot或者matplotlib作圖時就要頭疼選顏色的問題,這里有一...
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奮斗在人類組學(xué)數(shù)據(jù)分析的一線,要隨時跟上最新的研究進(jìn)展。大型的研究項目會有全面的數(shù)據(jù)集和可視化工具,也有專門從各個數(shù)據(jù)源收集數(shù)據(jù)整合而成的數(shù)據(jù)庫。手頭備幾個,方便查閱。 Ge...
本系列主要內(nèi)容 介紹ENCODE的數(shù)據(jù)概況,在data portal上查詢數(shù)據(jù),使用REST API批量下載數(shù)據(jù),參照ENCODE官方數(shù)據(jù)處理流程構(gòu)建自己的pipeline。...
本篇主要內(nèi)容 本篇主要介紹兩種方法,搜索并批量下載ENCODE數(shù)據(jù)。 方法一:在頁面中搜索并獲取下載地址 進(jìn)入ENCODE portal主頁:https://www.enco...
作為一名生物信息“工程師”,日常的工作環(huán)境是基于Unix的計算機(jī)集群,因此最常用的就是shell腳本。它可以簡單的處理數(shù)據(jù),再加上迷你語言sed和awk,也能滿足日常需求了。...