因為課題需要，我們在前期組裝了一個基因組并進(jìn)行了注釋，但是存在兩個問題，一個是沒有考慮可變剪切，另一個是注釋的基因并不準(zhǔn)確，三代轉(zhuǎn)錄組的廣泛普及對于基因研究提供了很大的便利，...
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IP屬地：山東
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利用三代轉(zhuǎn)錄本升級基因組注釋（gff3） -
VCF格式轉(zhuǎn)換(plink, hapmap)
格式轉(zhuǎn)換 hapmap格式：hmp.txt plink格式：ped和map以及二進(jìn)制文件bed/bim/fam vcf格式：vcf 1.1. hapmap <-> vcf #...
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2019-10-28轉(zhuǎn)錄組實(shí)戰(zhàn)
ENA數(shù)據(jù)庫網(wǎng)址：https://www.ebi.ac.uk/ena/browser/view/SRR949627參考流程1：https://blog.csdn.net/qq...
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一個高雜合真菌基因組組裝腳本（改代碼版）
前言及背景 什么是基因組de?novo測序？其是對某一物種進(jìn)行高通量測序，利用高性能計算平臺和生物信息學(xué)方法，在不依賴于參考基因組的情況下進(jìn)行組裝，從而繪制該物種的全基因組序...
