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    2018-09-30 如何理解survivalROC包的統(tǒng)計學(xué)原理

    生存分析中的ROC是怎么來的,ROC是對二分類資料的評價指標,那對于生存資料呢? 首先我們分析生存資料的特點:(1)包含有結(jié)局和時間兩個方面的信息。(2)結(jié)局資料一般為二分類...

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    2018-09-25 統(tǒng)計入門第1篇 cox回歸

    我對學(xué)習(xí)的總結(jié)是:WOLF定律W:whatO:organizationL:logisticF:familiar先說what 什么是回歸?英國著名統(tǒng)計學(xué)家弗朗西斯·高爾頓(Fr...

  • 2018-09-24 vim命令詳解

    vim:文本編輯器vi:visual interfacevim: VI improved全屏編輯器,模式化編輯器 vim打開文件 vim /path/to/somef...

  • 2018-09-24 wes文獻閱讀4

    Title:胃癌患者調(diào)節(jié)DNA重組修復(fù)的PALB2,BRCA1和RAD51C基因的種系突變 Journal: GastroenterologyIF:20.773Article...

  • 2018-09-24 wes流程文件解讀2

    上次我們整理到bwa比對后得到bam文件,下一步我們要通過GATK流程從bam文件中call variant。一、使用GATK前須知事項: 對GATK的測試主要使用的是人類全...

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    2018-09-23 WES流程文件解讀1

    wes定義: 全外顯子組測序,是利用目標序列捕獲技術(shù), 將全基因組編碼基因外顯子區(qū)域的DNA捕獲并富集后,進行高通量測序的基因組分析方法 通過測序可以找到大量的單核苷酸多態(tài)性...

  • 2018-09-24 conda命令詳解

    conda命令詳解 創(chuàng)建python版本的環(huán)境 conda create --name your_env_name python=2.7 #env 是environmen...

  • 2018-09-22 sed 命令詳解

    lunixs三大基本文本處理工具:grep sed awk 字符處理用法均涉及正則表達式,我們先學(xué)習(xí)正則 REGEXP: regular expression pattern...

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    2018-09-22 WES文獻閱讀3

    wes文獻抄讀3 Title:Whole-exome sequencing reveals the origin and evolution of hepato-cholan...

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