這是ggplot2可視化專題的第二個實(shí)例操作 【ggplot2的基本思路見前文總論】:基于ggplot2的RNA-seq轉(zhuǎn)錄組可視化:總述和分文目錄 【ggplot2繪圖具體...
這是ggplot2可視化專題的第二個實(shí)例操作 【ggplot2的基本思路見前文總論】:基于ggplot2的RNA-seq轉(zhuǎn)錄組可視化:總述和分文目錄 【ggplot2繪圖具體...
原文鏈接:Tian D, Zhang R, Zhang Y, Zhu X, Ma J. MOCHI enables discovery of heterogeneous in...
Seurat從3.0版本引進(jìn)了SCTransform這個函數(shù)用來對數(shù)據(jù)做標(biāo)準(zhǔn)化,并且這一個函數(shù)可以代替三個函數(shù)(NormalizeData, ScaleData, FindV...
hello,下半年開始,我們也要開始新的工作了,今天我們需要解決的問題有兩個。 (1)細(xì)胞亞群細(xì)分的時候仍然要分開樣本去除批次效應(yīng)???harmony (2)harmony算...
【Juicer差異loop分析】HiCCUPSDiff HiCCUPS Diff 可以幫助你尋找差異loop注意:HiCCUPSDiff works by checking ...
分析流程 1.上傳四個樣本原始就文件到服務(wù)器 參考http://www.itdecent.cn/p/a84cd44bac67[http://www.itdecent.cn...
GenomicFeatures包主要提供了TxDb對象結(jié)構(gòu)。基于此對象的操作,we can easily download the genomic locations of ...
前面RNA-seq分析:從軟件安裝到富集分析部分已經(jīng)把轉(zhuǎn)錄組全部流程走完了一遍,這次利用RNA-seq(2)-2:下載數(shù)據(jù)中下載的肝癌數(shù)據(jù)進(jìn)行分析,不在贅述細(xì)節(jié),所以有看細(xì)節(jié)...
關(guān)于ATAC-seq分析,在網(wǎng)上看到兩篇關(guān)于同一片綜述的翻譯,寫的很好:ATAC-seq數(shù)據(jù)分析工具的比較和推薦(Genome Biology綜述)ATAC-seq生信分析綜...