@我們一起舔過(guò)鐵欄桿 首先你確認(rèn)下你當(dāng)前使用的是gcc 4.8版本的？ gcc --version
如果不行，你試著把R的版本調(diào)低一點(diǎn)，3.x
Linux上基于R安裝Peer包閑言一下：一般不太喜歡寫這種類型的帖子的（大部分安裝步驟網(wǎng)上重復(fù)的帖子都很多），之所以要寫下這個(gè)包的安裝，是因?yàn)檫@個(gè)包比較小眾，帖子不多，再者我沒想到做生信這么多年，裝包無(wú)數(shù)...
mysql --user=genome -N --host=genome-mysql.cse.ucsc.edu -A -D hg38 -e "select name,name...
1 簡(jiǎn)介 BCFtools 是一款多種實(shí)用工具的集合，它可以用于處理VCF文件和二進(jìn)制的BCF文件。它可以接受VCF格式、壓縮的VCF格式以及BCF格式，并能自動(dòng)檢測(cè)輸入的格...
請(qǐng)教一下bcftools 怎么過(guò)濾掉太多missing samples的變異。類似于vcftools中的max-missing 操作
最全bcftools使用說(shuō)明--只看本文就夠了1 簡(jiǎn)介 BCFtools 是一款多種實(shí)用工具的集合，它可以用于處理VCF文件和二進(jìn)制的BCF文件。它可以接受VCF格式、壓縮的VCF格式以及BCF格式，并能自動(dòng)檢測(cè)輸入的格...
@素瑾妍 你只要把想添加的封裝好，然后ggplot2里面通過(guò)geom_text函數(shù)添加就可以。你看我例子里面就用了兩側(cè)geom_text()，分別把公式和r2加進(jìn)去了。另外，這種其實(shí)效率也不好，你也可以畫好圖之后用AI 編輯手動(dòng)添加任何文字或者注釋信息都可以。
R語(yǔ)言散點(diǎn)圖-- ggplot2: scatterplot()R語(yǔ)言作圖點(diǎn)滴積累，今天要記錄ggplot2中散點(diǎn)圖的做法。散點(diǎn)圖算是數(shù)據(jù)展示中非常基礎(chǔ)的一種方法了吧，一般用于展示兩個(gè)變量之間的關(guān)系（比如線性相關(guān)）。按照慣例，我每次講一個(gè)...
下載源我沒有特別設(shè)置，應(yīng)該用的默認(rèn)的。
Linux上基于R安裝Peer包閑言一下：一般不太喜歡寫這種類型的帖子的（大部分安裝步驟網(wǎng)上重復(fù)的帖子都很多），之所以要寫下這個(gè)包的安裝，是因?yàn)檫@個(gè)包比較小眾，帖子不多，再者我沒想到做生信這么多年，裝包無(wú)數(shù)...
如果批量提交任務(wù)后，發(fā)現(xiàn)有錯(cuò)誤，想要撤回，一個(gè)一個(gè)撤回太麻煩，如何批量地殺掉指定用戶所有的作業(yè)呢？只需如下一條命令就可以：qselect -u | xargs qdel
一不小心在給文件重命名的時(shí)候輸入了中文字符，結(jié)果導(dǎo)致文件名亂碼，無(wú)法通過(guò)cat, less, rm 或者mv 之類的命令操作了。 如何重新命名它，使得其恢復(fù)正常呢？ 據(jù)說(shuō)li...
在集群服務(wù)器上使用R語(yǔ)言，經(jīng)常會(huì)碰到很抓狂的事情，那就是服務(wù)器沒連因特網(wǎng)，而我們要安裝一些第三方的R包。以前寫過(guò)一篇R包的常用安裝方法(https://www.jianshu...
最近有個(gè)任務(wù)需要從基因組中提取所有的內(nèi)含子（intron）區(qū)域。一開始覺得很簡(jiǎn)單，用ensembl上的biomart或者ucsc genome browser一頓猛點(diǎn)應(yīng)該就可...
閑言一下：一般不太喜歡寫這種類型的帖子的（大部分安裝步驟網(wǎng)上重復(fù)的帖子都很多），之所以要寫下這個(gè)包的安裝，是因?yàn)檫@個(gè)包比較小眾，帖子不多，再者我沒想到做生信這么多年，裝包無(wú)數(shù)...
參考：https://cran.r-project.org/web/packages/data.table/data.table.pdf 描述 "freda" 用于常規(guī)分隔文...
今天讀文章碰到一個(gè)生僻的概念（只是對(duì)于我這個(gè)遺傳學(xué)學(xué)渣來(lái)說(shuō)的），叫 ”narrow-sense heritability". 讀到這個(gè)的時(shí)候，腦海里冒出來(lái)兩個(gè)問(wèn)號(hào)：？1. h...
一般情況下我們都使用p<0.05作為閾值來(lái)拒絕原假設(shè)（零假設(shè)）。這個(gè)跟用哪個(gè)檢驗(yàn)方法無(wú)關(guān)
生物學(xué)研究中常見的統(tǒng)計(jì)檢驗(yàn)方法(二：Wilcoxon test)上一篇我簡(jiǎn)單整理了t-test的用法和注意事項(xiàng) （我們主要講兩個(gè)獨(dú)立隨機(jī)樣本的t-test）。我們?cè)倩仡櫼幌拢瑃-test是參數(shù)統(tǒng)計(jì)檢驗(yàn)方法，其應(yīng)用的假設(shè)前提是檢測(cè)變量的值服...
在NGS分析入門階段，我們不需要考慮太多的細(xì)節(jié)，只用知道一個(gè)分析的大致流程并完整跑下來(lái)即可。太多的細(xì)節(jié)，只會(huì)讓我們對(duì)于分析產(chǎn)生莫須有的恐懼，因此一些“無(wú)關(guān)緊要“細(xì)節(jié)就被我們刻...
上一篇我簡(jiǎn)單整理了t-test的用法和注意事項(xiàng) （我們主要講兩個(gè)獨(dú)立隨機(jī)樣本的t-test）。我們?cè)倩仡櫼幌?，t-test是參數(shù)統(tǒng)計(jì)檢驗(yàn)方法，其應(yīng)用的假設(shè)前提是檢測(cè)變量的值服...
抱歉，annoText這里我忘記加在代碼里了。它其實(shí)就是自己定義的一個(gè)data.frame. 有三列（對(duì)應(yīng)代碼中的degree,complex 和WD40id），前兩列表示x和y坐標(biāo)值，最后一列表示對(duì)應(yīng)坐標(biāo)上的label.
R語(yǔ)言散點(diǎn)圖-- ggplot2: scatterplot()R語(yǔ)言作圖點(diǎn)滴積累，今天要記錄ggplot2中散點(diǎn)圖的做法。散點(diǎn)圖算是數(shù)據(jù)展示中非常基礎(chǔ)的一種方法了吧，一般用于展示兩個(gè)變量之間的關(guān)系（比如線性相關(guān)）。按照慣例，我每次講一個(gè)...
好像是的，可能當(dāng)時(shí)畫圖的時(shí)候annoText是在命令行控制臺(tái)上寫的，沒有放進(jìn)代碼文件里。
R語(yǔ)言散點(diǎn)圖-- ggplot2: scatterplot()R語(yǔ)言作圖點(diǎn)滴積累，今天要記錄ggplot2中散點(diǎn)圖的做法。散點(diǎn)圖算是數(shù)據(jù)展示中非?；A(chǔ)的一種方法了吧，一般用于展示兩個(gè)變量之間的關(guān)系（比如線性相關(guān)）。按照慣例，我每次講一個(gè)...
