作者，Evil Genius~~ 空間轉(zhuǎn)錄組的運(yùn)用方向：轉(zhuǎn)錄、蛋白 ST最適合回答三種生物問題：首先可以闡明組織的細(xì)胞類型組成；第二類問題與細(xì)胞相互作用有關(guān)；最后可以幫助闡明...
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空間轉(zhuǎn)錄組的幾個分析要點(diǎn)及經(jīng)典文獻(xiàn)分享 -
CIBERSORT 免疫浸潤1.輸入數(shù)據(jù)要什么 下面這段話摘自CIBERSORT的介紹 Importantly, all expression data should be non-negative, ...
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【轉(zhuǎn)】Reading KEGG annotation online: fail to download KEGG data... Error in download.KEGG.Path(spe...本文轉(zhuǎn)載自：http://www.360doc.com/content/22/0604/23/76149697_1034565139.shtml 最近在做KEGG富集分析時，...
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sctransform預(yù)處理后，如何進(jìn)行差異表達(dá)分析一、seurat執(zhí)行差異表達(dá)分析 根據(jù)單細(xì)胞數(shù)據(jù)預(yù)處理的方式不同（lognormalize和sctransform），執(zhí)行差異表達(dá)分析代碼有所不同，這個需要注意。我當(dāng)時請教過...
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10X單細(xì)胞（10X空間轉(zhuǎn)錄組）分析回顧之一些細(xì)節(jié)繪圖操作臨近年底，我們要總結(jié)，馬上回家了，大家今天到底掙了點(diǎn)什么？？反省一下，今天的自己，有沒有更優(yōu)秀，這一篇我給大家分享一些單細(xì)胞分析圖片的細(xì)節(jié)操作，圖片是我們分析結(jié)果的展示，要美...
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捋一捋---活化的CD4 T cell 都有哪些亞型一：什么是CD4、什么是CD4T cell、什么是Actived CD4 T cell? CD4，屬于免疫球蛋白超家族的成員，主要表達(dá)于大部分胸腺細(xì)胞、T細(xì)胞亞群，在巨噬細(xì)胞...
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文獻(xiàn)學(xué)習(xí)023--[sc]腫瘤浸潤髓系細(xì)胞的pan-cancer單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄圖譜張澤民老師2021年2月份發(fā)表在cell上的文章 Tumor-infiltrating myeloid cells (TIMs) 是腫瘤進(jìn)展的關(guān)鍵調(diào)解者，但是它們在不同腫瘤間...
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10X空間轉(zhuǎn)錄組繪圖分析之體現(xiàn)兩種細(xì)胞類型的空間位置過年了，有錢沒錢，回家過年，但今天居然是工作日，太沒有人道了，今天我們就來簡單畫畫圖吧，我們來繪制一下空間轉(zhuǎn)錄組兩種細(xì)胞類型的空間位置分布圖，下面的圖應(yīng)該都很常見了。 要么是...
