一、4Dtv(四倍簡并位點顛換率)的定義 4DTV stands for four-fold synonymous (degenerative) third-codon tr...
一、4Dtv(四倍簡并位點顛換率)的定義 4DTV stands for four-fold synonymous (degenerative) third-codon tr...
寫在前面: 最近要將參考基因組(4.1G,粗山羊草)的每一條染色體單獨提取出來,之前我寫過一個使用faSomeRecords的帖子基因組學5-利用faSomeRecords根...
寫在前面 最近在利用小麥的重測序數(shù)據(jù)進行mapping,小麥是一個很奇特的物種,六倍體,有ABD三個基因組,基因組大小約為17Gb,因此,制約小麥重測序數(shù)據(jù)分析的一個很大的問...
安裝 從該網(wǎng)址下載其安裝腳本:http://hgdownload.cse.ucsc.edu/admin/exe/linux.x86_64/ 我一般都是保存在bin目錄下,cd...
寫在前面 最近服務器的我最常用的那個節(jié)點又壞了,那個環(huán)境我搭建的很好,幾乎所有數(shù)據(jù)和軟件都在那上面。但是,無奈之下只能換到另一個節(jié)點,一切都要從頭再來,就包括安裝軟件,事已至...
本期的主題仍然屬于《單個基因的生物信息學分析》,主要講解介紹一下單個蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)域分析。 網(wǎng)站鏈接如下:InterPro 打開主頁面顯示如圖1,注意的是,一次只能進行一個蛋白序...
在生物學分析中,我們經(jīng)常會針對某個基因進行生物學功能分析,比較常見的包括基因結(jié)構(gòu)預測,功能注釋,蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)域預測(跨膜域,信號肽),同源基因分析,多序列比對,亞細胞定位預測,...
對于各位小伙伴來說,無論是自己獨立進行高通量測序數(shù)據(jù)分析,還是解讀公司的測序結(jié)果,一個必須要面對的情況就是高通量測序數(shù)據(jù)的質(zhì)量控制,又稱Quality Control。照顧到...
常見的生物信息分析中,基因組的注釋文件和參考基因組具有相同重要的功能,如果說參考基因組是一個蘊含著所有資源的寶島,那么基因組的注釋文件就是航海路線圖。因此,理解基因組注釋文件...
今天將為大家介紹小麥的特有的生物學網(wǎng)站,該數(shù)據(jù)庫是由國際小麥基因組測序聯(lián)盟(International Wheat Genome Sequencing Consortium,...
小麥是世界上最重要的糧食作物之一,隨著新一代測序技術(shù)的發(fā)展,小麥的基因組學發(fā)展迅速。本文主要介紹小麥常用的基因組數(shù)據(jù)庫以及基因組數(shù)據(jù)庫下載,方便為從事小麥研究的同學提供一...
有一個問題,如果我時行分割沒有空格的一個字符串,該怎么辦?我有一行數(shù)據(jù)是“aaaaaa”,怎么進行分割呢
python split() 方法本文講述的是string.split(s[, sep[, maxsplit]]),針對string類型的split()函數(shù)。它主要是切割字符串,結(jié)果返回由字符串元素組成的一個...