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    基因組注釋之從頭預測

    1.創(chuàng)建本地BLAST數(shù)據(jù)庫 使用makeblastdb程序,對上述FASTA格式的蛋白 質(zhì)序列進行處理,建立本地BLAST數(shù)據(jù)庫。makeblastdb -in ./uni...

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    基因組注釋之同源搜索

    1.在uniprot下載fungi蛋白質(zhì)序列 在uniport數(shù)據(jù)庫輸入taxonomy:fungi AND reviewed:yes查找蛋白質(zhì)相關(guān)數(shù)據(jù),總共找到33905條...

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    序列組裝

    1.利用fastqc對模擬測序的序列進行質(zhì)控分析 1.1 使用art-illumina模擬測序,生成高通量數(shù)據(jù)(art-illumina模擬測序) 1.2 安裝fastq及質(zhì)...

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