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單細胞之軌跡分析-2：monocle2 原理解讀+實操 -
seurat-ScaleData()源碼解析一、ScaleData()簡介 單細胞基因表達counts矩陣數(shù)據(jù)經(jīng)過NormalizeData()歸一化處理后，還需要進行scale標準化。ScaleData()[http...
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單細胞 scATAC 分析 -- Signac（二）參照 Signac 官方分析流程 Analyzing PBMC scATAC-seq ? Signac (stuartlab.org)[https://stuartlab.o...
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單細胞 scATAC 分析 -- cellranger-atac（一）參考 cellranger-atac 官方流程： Single Cell ATAC - Official 10x Genomics Support[https://www.1...
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世上至強 植物PhasiRNA 數(shù)據(jù)分析流程！寫在前面 沒錯，標題黨就是我！這幾天在忙課題的一些東西，其中涉及到一些 PhasiRNA 數(shù)據(jù)分析。討論了一下，發(fā)現(xiàn)了一些陳年老 bugs。主要原因在于需求變了，所以代碼邏輯...
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個人向ggplot2箱線圖總結(jié)主要從如何看圖、用圖與作圖三個方面來對箱線圖進行理解和總結(jié)。 1、看圖 如圖所示，箱線圖是將一組數(shù)據(jù)按照大小順序排列后進行繪制的，包含6個數(shù)據(jù)節(jié)點，分別表示出數(shù)據(jù)的上邊緣、上...
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2?? 雙序列比對(2)：BLAST詳細操作:web版和linux版序列比對和序列特征分析總目錄 網(wǎng)址：https://blast.ncbi.nlm.nih.gov/Blast.cgi運行方式：本地或web 基本的BLAST工具包括： bla...
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安裝軟件、conda的重新安裝及其使用
一、軟件安裝 軟件安裝可以參考Jimmy寫的軟件的安裝代碼：生物信息學常見1000個軟件的安裝代碼！http://www.biotrainee.com/thread-856-...
