如果從TCGA官網(wǎng)網(wǎng)頁(yè)下載數(shù)據(jù)，或者使用gdc-client工具下載的數(shù)據(jù)，都是以單個(gè)的文件夾形式存儲(chǔ)，并且文件夾中的為壓縮文件，所以，下載數(shù)據(jù)后，第一步就是如何把這些文件復(fù)...
IP屬地：廣東
-
整理從TCGA下載的數(shù)據(jù)
-
【R實(shí)戰(zhàn)】如何優(yōu)雅智能的畫(huà)出帶標(biāo)注的火山圖本來(lái)說(shuō)這期是要更新LncRNA鑒定思路的，但是看到上一期人氣低迷，就暫時(shí)晚點(diǎn)在弄了，這次就來(lái)跟大家分享一下火山圖 什么是火山圖？ 顧名思義，火山圖就是一個(gè)長(zhǎng)得有點(diǎn)像火山的圖形...
-
ComplexHeatmap熱圖繪制 | 指定基因在熱圖中標(biāo)記如想獲得圖例代碼和數(shù)據(jù)，請(qǐng)到公眾號(hào)“小杜的生信筆記”中回復(fù)“20220117”，鏈接有效期2022.17-2022.2.17（特別申明：該數(shù)據(jù)僅是演示數(shù)據(jù)，無(wú)任何意義） 教程...
-
GO/KEGG富集分析及R包繪圖（氣泡圖/條形圖）導(dǎo)讀 利用富集分析，我們可以把很多看著雜亂的差異基因總結(jié)出一個(gè)比較整體反應(yīng)事件發(fā)生的概述性的句子。 例如：TP53信號(hào)通路和胃癌的發(fā)生有關(guān)。而不是說(shuō)BAX、BID、ABL1、...
-
R語(yǔ)言基礎(chǔ)教程 | 文件的輸入與輸出
做生物信息分析，少不了的就是數(shù)據(jù)，比如轉(zhuǎn)錄組的數(shù)據(jù)，無(wú)論是下載的還是測(cè)序的，用R進(jìn)行分析，就必須將這些數(shù)據(jù)讀入，分析的結(jié)果，比如一些圖，就少不了輸出，因此，文件的讀寫(xiě)在數(shù)據(jù)分...
-
-
生信log22|CGviewer升級(jí)啦-交互式操作畫(huà)基因組Circos圈圖（使用和評(píng)價(jià)）用Circos華麗地展現(xiàn)基因組信息，能給論文的錦上添花。很多做基因組分析的文章必有一個(gè)點(diǎn)就是展示基因組的圈圖，目前的去比較好實(shí)現(xiàn)這種可視化的一般依靠perl語(yǔ)言（最原始的版本...
