吸煙是結(jié)直腸癌（CRC）的危險因素。除了香煙煙霧的化學物質(zhì)，吸煙還可以通過改變腸道微生物群和相關代謝物來促進結(jié)直腸癌。通過小鼠模型是否暴露于香煙，研究其糞便重的微生物群和代謝...
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2022-04-09 吸煙導致腸癌的另一個因素：微生物群的影響
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全基因組重測序流程【超細致??！】
自己在研究生的第一個項目就是處理重測序數(shù)據(jù)，在做的過程中參考了很多資料，現(xiàn)在把整個重測序的上游分析流程分享給大家，一些關鍵環(huán)節(jié)已經(jīng)幫大家踩過坑了，相信跟著學習實踐一定能夠收獲...
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GWAS基石---混合線性模型??使用混合線性模型（linear mixed model)做GWAS可以有效校正群體結(jié)構(gòu)和群體內(nèi)復雜的親緣關系。因此，目前絕大多數(shù)的GWAS都是使用的混合線性模型。近年來，...
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重復一篇文獻的GWAS（二）：用GEMMA跑GWAS上一篇寫的是：重復一篇文獻的GWAS（一）：基因型數(shù)據(jù)整理這一篇主要講GWAS的核心流程和畫圖。 軟件使用參考：使用GEMMA進行復雜性狀全基因組關聯(lián)分析(GWAS)http...
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NGS原理- 單細胞轉(zhuǎn)錄組測序-橫評 CEL-seq2, Drop-seq, MARS-seq, SCRBseq, Smart-seq和Smart-seq2【轉(zhuǎn)載】自 PLOB單細胞RNA測序方案比較 目前，隨著單細胞RNA測序技術(shù)（scRNA）的成熟，新的測序方案不斷出現(xiàn)。那么，各種技術(shù)平臺的性能如何呢？優(yōu)缺點有哪些呢？如何根...
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生信技能樹線上課程：RNA-seq寫在前面 很榮幸參加生信技能樹全國巡講-第一站-重慶站的RNA-seq線下培訓課程。以下為線下課結(jié)合線上課所做的筆記，希望能幫到你。 一些小練習題 下面開始RNA-seq流程...
