經(jīng)典的GWAS原理圖，補一個在這里 GWAS是找與當前性狀相關的snppheWAS是找與當前snp相關的性狀 那么這樣看，GWAS可以通過單個研究來做，pheWAS基本上就是...
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IP屬地：重慶
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【MR】pheWAS -
單細胞RNAseq常規(guī)分析流程（10X）降維聚類，類型鑒定，差異分析 近年來，單細胞測序的成本逐漸降低，使得大眾研究從組織水平轉移到單個細胞水平的分析成為可能。本文主要是簡單介紹一下SingleCellRNAseq...
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孟德爾隨機化發(fā)高分SCI必備的一些基本概念及計算-MAF
大家好，孟德爾隨機化很多人都是從TwoSampleMR包入手學習的，很多GWAS的概念如果不搞清楚，寫SCI的時候容易犯一些概念性的錯誤，低分的雜志可能大家都很水，可能也就一...
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拯救你那些富集不到結果的基因數(shù)據(jù)整理 因為這個是我學生的真實數(shù)據(jù)，所以就不方便放出來給大家做示例文件了，可以只看代碼，或者拿自己的數(shù)據(jù)練練手。 975個基因做不出GO富集，我的第一反應是孩子學藝不精，然...
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VCF文件參數(shù)解讀VCF (variant callformat) 文件記錄了所有樣品基因組中所有位置變異（主要包括SNP和InDel）信息。后續(xù)幾乎所有分析內容都是基于此文件，如進化樹分析、...
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多組學水平的孟德爾隨機化分析+three-step SMR 應用實操
多組學分析：在基因表達、表觀遺傳、蛋白、單細胞及微生物組學等水平上，利用組學數(shù)據(jù)比較不同組學水平的疾病和健康對照，從而鑒定潛在的致病機制。 藥物靶點孟德爾隨機化分析：探究是其...
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生信數(shù)據(jù)庫ID大總結&ID轉換方法
首先介紹下各個ID的轉換，比較便捷的有： 1.在線的：Uniprot ： ID mapping 工具，可以批量轉換和下載https://www.uniprot.org/id-...
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論孟德爾隨機化與單細胞聯(lián)合研究的可能性因為我自己研究的領域跨單細胞、QTL、以及孟德爾隨機化，所以就一直在思考這個問題：單細胞能不能和孟德爾隨機化聯(lián)合起來研究？ 這方面的文章或者研究比較少。兩個組學能夠聯(lián)合我能想...
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GWAS分析-P值和beta值的愛恨相殺 (六)前面已經(jīng)簡單介紹過GWAS的概念，GWAS分析中所用到的文件以及分析流程，我們在GWAS分析結果文件中經(jīng)常會看到beta值和P值，他們分別代表什么意思？這兩個值又有什么關系呢...
