已有的工具如circos, 只能繪制彎的染色體，又如R包chromoMap，IdeoViz，karyploteR，ggbio和在線工具Idiographica，雖然能繪制直的...
發(fā)簡信
IP屬地：陜西
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RIdeogram：染色體數(shù)據(jù)可視化的R包 -
Augustus安裝教程
Augustus是一個使用頻率很高的程序，但是安裝卻麻煩的一批，而且說明書對新手也很不友好； 網(wǎng)上倒是有很多安裝的解答，可能是每個機子的情況不太一樣，沒有一個講的比較全面的，...
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從NCBI-SRA和EBI-ENA數(shù)據(jù)庫下載數(shù)據(jù)NCBI-SRA和EBI-ENA數(shù)據(jù)庫 SRA數(shù)據(jù)庫: Sequence Read Archive：隸屬NCBI (National Center for Biotechno...
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使用purge_haplogs處理基因組雜合區(qū)域FALCON和Canu的組裝后會得到一個單倍型融合的基因組，用來表示二倍體基因組。之后，F(xiàn)ALCON Unzip和Supernova這類軟件進一步處理其中等位基因區(qū)域，將這部...
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使用MAKER進行基因注釋(高級篇之AUGUSTUS模型訓練）
準備訓練集和測試集 根據(jù)Augutus的官方教程，可靠的基因結(jié)構(gòu)序列的要求如下： 提供基因的編碼部分，包含上游幾KB。通常而言，基因越多，效果越好，至少準備200個基因以上。...
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BUSCO - 組裝質(zhì)量評估BUSCO - 組裝質(zhì)量評估軟件 BUSCO - Benchmarking Universal Single-Copy Orthologs 額。直譯的話就是普遍通用的單拷貝直...
