找到Matrix eQTL這個(gè)包,看下文章Matrix eQTL: ultra fast eQTL analysis via large matrix operations(...
請(qǐng)問(wèn)博主有更好的辦法么,我跑了下代碼,只匹配了很少一部分
無(wú)痛解決基因全稱與縮寫(xiě)的轉(zhuǎn)換“山窮水盡疑無(wú)路,柳暗花明又一村” 某天,想收集一類藥物的作用靶點(diǎn),上了Drugbank獲取了全部數(shù)據(jù),加載到R中,解析出來(lái)后蒙圈了,它居然一個(gè)基因靶點(diǎn)對(duì)應(yīng)了多個(gè)名稱。這就很...
@ScorpioGirll 好的,現(xiàn)在了解啦,謝謝!
小鬼的WGCNA圖文詳解(四)-模塊與性狀相關(guān)性 圖還是老習(xí)慣,給出官網(wǎng)教程,至于你是看還是不看,它就在那里,等著你的深入研究~ https://horvath.genetics.ucla.edu/html/Coexpress...
期待后續(xù)!
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“臨床表型轉(zhuǎn)換為數(shù)值的trait的時(shí)候,直接涉及到了后面相關(guān)性的計(jì)算:”所以想請(qǐng)教一下,是不是比如不同疾病,就其他分類變量就改成1和0就好,可以改成10或0么,或100與0,這樣會(huì)影響相關(guān)性結(jié)果么,謝謝您!
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寫(xiě)在前面,這篇文章主要整理自于Gene co-expression analysis for functional classification and gene–disea...
The Connectivity Map, or CMap, is a resource that uses cellular responses to perturbati...
Nov 21, 2019更新 => 修正部分function代碼,實(shí)現(xiàn)了導(dǎo)出gene2module 目的 最近有個(gè)項(xiàng)目又準(zhǔn)備跑WGCNA,之前跑通過(guò)一個(gè),然后很久沒(méi)碰,...
主要簡(jiǎn)單總結(jié)省心的工具,具體用的時(shí)候再查就好。 替換功能 善用星號(hào)(*),問(wèn)號(hào)(?),連接文本(&)示例:有兩個(gè)大組數(shù)據(jù),每組數(shù)據(jù)均有兩列,對(duì)其整體取交集,各組兩列分別為;"...
本來(lái)覺(jué)得轉(zhuǎn)錄組上游暫時(shí)先不用學(xué)習(xí),但是在處理原始數(shù)據(jù)時(shí)候,發(fā)現(xiàn)下載后,需批量處理樣本,解壓縮,及修改文件名。批量處理?欸,可以用LINUX,去百度了以下方法,待更新; 繼續(xù)百...