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實驗記錄13: scanpy細(xì)胞分化軌跡推斷大型真香現(xiàn)場與上次翻車實驗的不同: 過濾了更多的細(xì)胞和基因。在處理數(shù)據(jù)時,低質(zhì)量的細(xì)胞一定要清除掉,告誡大家寧缺毋濫。。。否則后續(xù)分析真的是一堆的噪點。 跳過了scanpy中的降噪步驟。...
寫的連載太棒啦,獲益匪淺
,想問下注釋細(xì)胞類型的具體過程嗎?比如是不是選取每個cluster的前幾位marker gene,然后每個marker gene都去搜文獻(xiàn)看是對應(yīng)什么細(xì)胞類型?能不能分享下具體的步驟呢?
實驗記錄13: scanpy細(xì)胞分化軌跡推斷大型真香現(xiàn)場與上次翻車實驗的不同: 過濾了更多的細(xì)胞和基因。在處理數(shù)據(jù)時,低質(zhì)量的細(xì)胞一定要清除掉,告誡大家寧缺毋濫。。。否則后續(xù)分析真的是一堆的噪點。 跳過了scanpy中的降噪步驟。...
與上次翻車實驗的不同: 過濾了更多的細(xì)胞和基因。在處理數(shù)據(jù)時,低質(zhì)量的細(xì)胞一定要清除掉,告誡大家寧缺毋濫。。。否則后續(xù)分析真的是一堆的噪點。 跳過了scanpy中的降噪步驟。...