一、基本概念 方差分析（analysis of variance）用于研究一個(gè)或多個(gè)分類型自變量與一個(gè)數(shù)值型因變量的關(guān)系。方差分析通過檢驗(yàn)多個(gè)總體的均值是否相等來判斷一個(gè)或多...
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方差分析（analysis of variance）基本概念 -
統(tǒng)計(jì)方法的選擇（1）--正態(tài)性和方差齊性將“二八法則”運(yùn)用到我們的統(tǒng)計(jì)學(xué)習(xí)中，就是用20%的時(shí)間精力去習(xí)得最重要最常用80%的技巧和能力。統(tǒng)計(jì)學(xué)的東西很多很繁雜，如果面面俱到的話，精力不夠，時(shí)間不足，還不一定能用的...
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GWAS之表型最優(yōu)無偏預(yù)測（BLUP)與遺傳力計(jì)算表型分析之最優(yōu)無偏預(yù)測 最佳線性無偏預(yù)測（Best Linear Unbiased Prediction，簡稱BLUP）可以對多環(huán)境數(shù)據(jù)進(jìn)行整合，去除環(huán)境效應(yīng)，得到個(gè)體穩(wěn)定遺...
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GWAS顯著性閾值設(shè)置
Bonferroni校正P值：0.05/n，n為SNP個(gè)數(shù)。Bonferroni校正P值是最嚴(yán)格的多重檢驗(yàn)校正方法，假設(shè)每次檢驗(yàn)為獨(dú)立事件，因此除以n。 《Associati...
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基因表達(dá)分析（上）- 差異表達(dá)分析基因表達(dá) 什么是基因表達(dá)，如下是來自于維基百科的解釋： 研究方法 定量PCR 這部分我不太懂，所以就放幾段百度百科和維基百科的定義。 百度百科 定量PCR（即時(shí)聚合酶鏈鎖反應(yīng)...
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最大似然估計(jì)（ML）和REML
A.F. Zuur et al., Mixed Effects Models and Extensions in Ecology with R, p116-119, chr ...
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數(shù)學(xué)基礎(chǔ) | 協(xié)方差，協(xié)方差矩陣，方差-協(xié)方差矩陣
一、協(xié)方差 什么是協(xié)方差 當(dāng)X=Y，協(xié)方差就是方差 協(xié)方差有什么含義 協(xié)方差反應(yīng)兩個(gè)變量在變化過程中是同方向變化還是反方向變化，以及同向或反向程度如何。協(xié)方差為正，說明兩個(gè)變...
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ggpubr包學(xué)習(xí)筆記之輕松修改圖形參數(shù)簡介 越學(xué)習(xí)包ggpubr越感覺其功能強(qiáng)大，本文主要講解一下如何修改圖形參數(shù)，我們知道ggplot2有著十分強(qiáng)大的繪圖功能，但是其參數(shù)之復(fù)雜足以讓人望而卻步。ggpubr提供...
