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# 大數(shù)據(jù)的統(tǒng)計(jì)學(xué)基礎(chǔ)
概率論與統(tǒng)計(jì)學(xué) 概率論是統(tǒng)計(jì)學(xué)的基礎(chǔ)，統(tǒng)計(jì)學(xué)沖鋒在應(yīng)用第一線(xiàn)，概率論提供武器。 我們?cè)趯W(xué)習(xí)R的時(shí)候，會(huì)做過(guò)假設(shè)檢驗(yàn)。做假設(shè)檢驗(yàn)的時(shí)候會(huì)有一個(gè)基本...
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突然間，我感覺(jué)我喜歡上了for，真心好用！今天健明大大的群里發(fā)布了一個(gè)小作業(yè)：數(shù)據(jù)框中的某一列存在NA，目的是想用數(shù)據(jù)框的每一列的平均數(shù)替換每一列的NA值。今天周六，下午給老板交代完任務(wù)...
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植物重測(cè)序---變異檢測(cè)（samtools+bcftools篇）
植物基因組重測(cè)序除了GATK的方法進(jìn)行變異檢測(cè)以外，還有samtools+bcftools去進(jìn)行變異檢測(cè)。在這里我們不去分析哪一種分析方法好，使...
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scRNAseq上游分析
最近對(duì)單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組很感興趣，就跑了一跑~以下就是單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組的上游分析過(guò)程。如有不對(duì)，請(qǐng)大家多多指點(diǎn)。 1.cellranger-3.1.0下載...
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SnpEff結(jié)果解讀SnpEff結(jié)果文件的解讀 根據(jù)上一篇簡(jiǎn)書(shū)中SnpEff結(jié)果產(chǎn)生的4個(gè)文件進(jìn)行解讀 第一個(gè)文件：positive.snp.eff.vcf 其實(shí)p...
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SnpEff使用方法
SnpEff使用方法 SnpEff 軟件通過(guò)基因組結(jié)構(gòu)注釋數(shù)據(jù)（GTF文件），對(duì)VCF文件中的SNP/InDel信息進(jìn)行注釋?zhuān)粗饕忉屃薙NP...
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水稻RNA-seq數(shù)據(jù)分析（上游）
水稻（學(xué)名：Oryza sativa）是草本稻屬的一種，也是稻屬中作為糧食的最主要最悠久的一種，又稱(chēng)為亞洲型栽培稻，簡(jiǎn)單來(lái)說(shuō)也可以說(shuō)是稻。全世界...
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2019/9/30 武大讀博一個(gè)月
開(kāi)學(xué)一個(gè)月，簡(jiǎn)書(shū)解封了！ 博士開(kāi)學(xué)一個(gè)月，生活和科研的環(huán)境已經(jīng)完全適應(yīng)。 開(kāi)學(xué)一個(gè)月，每天游走于水稻國(guó)重和湖濱宿舍，沿途路過(guò)櫻園，每晚伴著東湖入...
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2019-07-31如何獲取轉(zhuǎn)錄本ID和基因ID的對(duì)應(yīng)關(guān)系--生信技能樹(shù)第一個(gè)任務(wù)：任意物種拿到轉(zhuǎn)錄本ID 與基因ID的對(duì)應(yīng)關(guān)系列表 從ensemble數(shù)據(jù)庫(kù)中下載了Human的基因組注釋文件gtf文件 1.下載Hu...