以下是B站生信技能樹GEO數(shù)據(jù)庫挖掘的課程筆記 主要內(nèi)容及學(xué)習(xí)目的: 介紹GEO數(shù)據(jù)庫:了解數(shù)據(jù)存放位置; 介紹GSE項(xiàng)目的3種下載方式; 介紹ID轉(zhuǎn)換:使用R語言技巧實(shí)現(xiàn)基...
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一句話評(píng)價(jià)通過動(dòng)態(tài)模型評(píng)估細(xì)胞瞬間狀態(tài)的RNA速度 文章信息題目:Generalizing RNA velocity to transient cell states thr...
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GSEA-analysis 1.加載數(shù)據(jù) 載入前一步分析得到的表達(dá)矩陣 2.批量相關(guān)性分析 將第一行目的基因跟其他行的編碼基因批量做相關(guān)性分析,得到相關(guān)性系數(shù)以及p值。 3....
15年3月發(fā)表的一篇高引文章https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC4542312/ Cited by: 371 Publi...
參考學(xué)習(xí)資料:還是小潔老師的TCGA-3.R包TCGA-biolinks下載數(shù)據(jù)下載安裝包 這個(gè)包有點(diǎn)大,安裝需要點(diǎn)時(shí)間其實(shí)從知道這個(gè)包名,應(yīng)該就知道怎么學(xué)習(xí)了,不用贅述 學(xué)...
Global transcriptome analysis for identification of interactions between coding and non...