Juicer: 輔助基因組組裝 導(dǎo)讀 本文主要對處理HiC數(shù)據(jù)的Juicer程序進行一個簡短的介紹，并展示如何利用Juicer進行基因組組裝中染色體掛載的第一步。 1. 介紹...
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Juicer: 輔助基因組組裝
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【轉(zhuǎn)】單倍型基因組組裝方法1. 什么是單倍型？ 同源染色體：同源染色體，一個來自母本，一個來自于父本。 單倍型：單倍體基因型的簡稱。遺傳學(xué)上指在單條染色體上一系列遺傳變異位點的組合。 2. 單倍型組裝...
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基于3D-DNA，ALLHiC掛載二倍體基因組關(guān)于3D-DNA，前面已經(jīng)有簡單介紹，本次主要介紹ALLHiC分析流程 ALLHiC的流程主要分為以下5個步驟： Prune: 修剪（二倍體基因組可以不用） Partitio...
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使用EDTA評估基因組LAI值EDTA的功能設(shè)計是用來de novo注釋全基因組的TE序列 安裝EDTA EDTA github[https://github.com/oushujun/EDTA] ED...
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生信 | 基因組組裝實戰(zhàn)（二）：Survey數(shù)據(jù)質(zhì)控、NT比對寫在前面 以下內(nèi)容均來自我在菲沙基因（Frasergen[http://www.frasergen.com/]）暑期生信培訓(xùn)班上記錄的課堂筆記 1. Survey分析的目的 ...
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生信 | 基因組組裝實戰(zhàn)（一）：基礎(chǔ)知識與基本思路寫在前面 以下內(nèi)容均來自菲沙基因（Frasergen[http://www.frasergen.com/]）暑期生信培訓(xùn)班課堂筆記 1. Genome de nove 基礎(chǔ)知...
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如何使用Juicebox 對juicer和3dDNA運行后的HiC結(jié)果進行可視化編輯推薦首先研讀官方github教程 Juicebox Assembly Tools[https://github.com/aidenlab/Juicebox/wiki/Juic...
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2024-07-25 liunx系統(tǒng)技術(shù)歷史命令
建立一個.inputrc文件夾 # /etc/inputrc - global inputrc for libreadline # See readline(3readlin...
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2021-05-20 ###520###之親愛的在哪里？
神奇動物在哪里？（linux命令中which、whereis、locate有什么區(qū)別？） 1.find find是最常用和最強大的查找命令。它能做到實時查找，精確查找，但速度...
