最近在后臺(tái)有不少讀者留言想要了解一下網(wǎng)狀meta分析,而我恰好前兩天幫一位醫(yī)生朋友處理了一次連續(xù)型變量的網(wǎng)狀meta分析,那么本文我將以其中的部分?jǐn)?shù)據(jù)為例,向大家詳細(xì)展示一下...
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TCGA數(shù)據(jù)庫(kù)中含有的癌癥名稱(chēng),簡(jiǎn)寫(xiě)和中文名稱(chēng) Abbr英文名稱(chēng)中文名稱(chēng)ACCAdrenocortical carcinoma腎上腺皮質(zhì)癌BLCABladder Urothe...
一、?? 玉米: ZEAMAP[http://www.zeamap.com/zmap_tissue_expression],需要注冊(cè)才能下載tsv數(shù)據(jù)。Zeamap Tissu...
如何判斷芯片表達(dá)矩陣是否需要均一化 以GSE43292為例https://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE4329...
通過(guò)加載GEOquery包,使用getGEO函數(shù)可以得到對(duì)應(yīng)GEO號(hào)的表達(dá)矩陣,注釋信息,樣本信息等。以GSE76275為例。 然而由于網(wǎng)絡(luò)等問(wèn)題,getGEO函數(shù)可能會(huì)出錯(cuò)...
作者:白介素2 這一節(jié)的內(nèi)容包括應(yīng)用 GEOquery包下載芯片數(shù)據(jù),提取表達(dá)矩陣,提取metadata信息。解決一個(gè)探針對(duì)應(yīng)多個(gè)基因的問(wèn)題 GEO數(shù)據(jù)下載-GEOquery...
筆記說(shuō)明 tidyr包是一個(gè)用于整理數(shù)據(jù)結(jié)構(gòu)的r包,也是tidyverse的核心包之一。本次筆記介紹tidy data、長(zhǎng)數(shù)據(jù)、寬數(shù)據(jù)的相關(guān)概念以及用于長(zhǎng)數(shù)據(jù)、寬數(shù)據(jù)相互轉(zhuǎn)換...
## 如何了解一個(gè)數(shù)據(jù)框 ## 看頭 head(exprSet) ##前6行 head(exprSet)[,1:5] ##選取1-5列 ## 看尾 tail(exprSet)...