為什么call peak的時候RYBP用的q值是0.01而其他樣本都用的0.05，這是RYBP沒有peak的原因嗎？
ChIP-seq基礎(chǔ)入門理解ChIP-Seq 到了目前這個水平，我學習新的高通量數(shù)據(jù)分析流程時已經(jīng)不再考慮代碼應(yīng)該如何寫的問題了。我更多要去考慮一個技術(shù)的目的和意義。 轉(zhuǎn)錄組主要研究的問題是基因在不...
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ChIP-seq基礎(chǔ)入門理解ChIP-Seq 到了目前這個水平，我學習新的高通量數(shù)據(jù)分析流程時已經(jīng)不再考慮代碼應(yīng)該如何寫的問題了。我更多要去考慮一個技術(shù)的目的和意義。 轉(zhuǎn)錄組主要研究的問題是基因在不...
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個人博客: xuzhougeng.top (隨緣訪問)
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RNA-seq，Ribo-seq數(shù)據(jù)分析（上）
文獻：The Tomato Translational Landscape Revealed by Transcriptome Assembly and Ribosome P...
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全基因組關(guān)聯(lián)分析流程
按照前人的教程，跑了跑GWAS流程，作為初學者，歡迎大家提問，指教。 數(shù)據(jù)來源：A new regulator of seed size control in Arabido...
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請教一下師兄，提取172個樣本之后有些位點出現(xiàn)的MAF=0，是不是就是說，在大群體中該位點有變異而對于這個172樣本的群體而言這個位點沒有變異？
重復(fù)一篇文獻的GWAS（一）：基因型數(shù)據(jù)整理
文獻：A new regulator of seed size control in Arabidopsis identified by a genome-wide asso...
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RNA-seq中基因表達表達定量單位選擇
做RNA-seq可以比較不同樣本之間基因表達水平的差異，那么如何衡量基因的表達水平呢？ 最簡單的方法是，直接比較mapping到某一個基因的reads數(shù)目。但是這種做法有不足...
