劉小澤寫于19.2.21或許這還是個比較常用的需求 我們做轉(zhuǎn)錄組分析，得到的結(jié)果可能是FPKM。但是FPKM確實存在不準(zhǔn)確性，推薦使用TPM。 read count和FPKM...
發(fā)簡信
IP屬地：山東
-
簡單小需求：如何將FPKM轉(zhuǎn)換成TPM？
-
2018-09-30 如何理解survivalROC包的統(tǒng)計學(xué)原理生存分析中的ROC是怎么來的，ROC是對二分類資料的評價指標(biāo)，那對于生存資料呢？ 首先我們分析生存資料的特點：（1）包含有結(jié)局和時間兩個方面的信息。（2）結(jié)局資料一般為二分類...
-
TCGA TOBACCO_SMOKING_HISTORY含義在UCSC Xena下載的臨床信息中有tobacco_smoking_history這列信息，從1到5，知道是跟吸煙有關(guān)但不知道什么數(shù)字含義，google查到可能的解釋 Li...
-
機器學(xué)習(xí)中的樣本不平衡問題在機器學(xué)習(xí)任務(wù)中，我們經(jīng)常會遇到這種困擾：數(shù)據(jù)不平衡問題。 數(shù)據(jù)不平衡問題主要存在于有監(jiān)督機器學(xué)習(xí)任務(wù)中。當(dāng)遇到不平衡數(shù)據(jù)時，以總體分類準(zhǔn)確率為學(xué)習(xí)目標(biāo)的傳統(tǒng)分類算法會過多地...
-
GEO數(shù)據(jù)庫簡介（2018-06-03）[轉(zhuǎn)] GEO數(shù)據(jù)庫--檢索界面及檢索結(jié)果簡介 原文：http://baijiahao.baidu.com/s?id=1575064181962032&wfr=spider&...
-
Bioconductor 分析芯片數(shù)據(jù)教程
這是我在 The Bioinformatics Knowledgeblog 上看到的一篇教程，原文在這里，教程條理清晰，對我理解芯片數(shù)據(jù)分析流程幫助很大，就把它翻譯了過來。 ...
-
用R分析芯片實戰(zhàn)（上）劉小澤寫于18.9.10實戰(zhàn)上從數(shù)據(jù)下載到差異基因的獲得、初步作圖實戰(zhàn)下進行富集分析，使用數(shù)據(jù)庫進行注釋在此感謝jimmy的limma包等教程 1 下載芯片數(shù)據(jù) 使用Fabb...
