劉小澤寫于19.2.21或許這還是個(gè)比較常用的需求 我們做轉(zhuǎn)錄組分析,得到的結(jié)果可能是FPKM。但是FPKM確實(shí)存在不準(zhǔn)確性,推薦使用TPM。 read count和FPKM...
劉小澤寫于19.2.21或許這還是個(gè)比較常用的需求 我們做轉(zhuǎn)錄組分析,得到的結(jié)果可能是FPKM。但是FPKM確實(shí)存在不準(zhǔn)確性,推薦使用TPM。 read count和FPKM...
生存分析中的ROC是怎么來的,ROC是對(duì)二分類資料的評(píng)價(jià)指標(biāo),那對(duì)于生存資料呢? 首先我們分析生存資料的特點(diǎn):(1)包含有結(jié)局和時(shí)間兩個(gè)方面的信息。(2)結(jié)局資料一般為二分類...
在UCSC Xena下載的臨床信息中有tobacco_smoking_history這列信息,從1到5,知道是跟吸煙有關(guān)但不知道什么數(shù)字含義,google查到可能的解釋 Li...
在機(jī)器學(xué)習(xí)任務(wù)中,我們經(jīng)常會(huì)遇到這種困擾:數(shù)據(jù)不平衡問題。 數(shù)據(jù)不平衡問題主要存在于有監(jiān)督機(jī)器學(xué)習(xí)任務(wù)中。當(dāng)遇到不平衡數(shù)據(jù)時(shí),以總體分類準(zhǔn)確率為學(xué)習(xí)目標(biāo)的傳統(tǒng)分類算法會(huì)過多地...
[轉(zhuǎn)] GEO數(shù)據(jù)庫(kù)--檢索界面及檢索結(jié)果簡(jiǎn)介 原文:http://baijiahao.baidu.com/s?id=1575064181962032&wfr=spider&...
這是我在 The Bioinformatics Knowledgeblog 上看到的一篇教程,原文在這里,教程條理清晰,對(duì)我理解芯片數(shù)據(jù)分析流程幫助很大,就把它翻譯了過來。 ...
劉小澤寫于18.9.10實(shí)戰(zhàn)上從數(shù)據(jù)下載到差異基因的獲得、初步作圖實(shí)戰(zhàn)下進(jìn)行富集分析,使用數(shù)據(jù)庫(kù)進(jìn)行注釋在此感謝jimmy的limma包等教程 1 下載芯片數(shù)據(jù) 使用Fabb...