丙辰中秋，歡飲達(dá)旦，大醉，作此篇，兼懷子由。 明月幾時(shí)有，把酒問青天。不知天上宮闕，今夕是何年。我欲乘風(fēng)歸去，又恐瓊樓玉宇，高處不勝寒。起舞弄清影，何似在人間。 轉(zhuǎn)朱閣，低綺...
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水調(diào)歌頭 -
RNA-seq(10):KEGG通路可視化:gage和pathview這部分直接從上部分RNA-seq(9):富集分析(功能注釋)[http://www.itdecent.cn/p/5d82acad6008]的數(shù)據(jù)而來，當(dāng)然如果你上部分?jǐn)?shù)據(jù)存...
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如何優(yōu)雅展示GO富集結(jié)果圖片好像加載不出來，可移步：https://blog.csdn.net/qq_38774801/article/details/114952565[https://blog....
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RNA-seq數(shù)據(jù)分析---方法學(xué)文章的實(shí)戰(zhàn)練習(xí)前言 這次給大家?guī)淼氖?6年發(fā)表在NATURE PROTOCOLS上面的一篇處理RNA-seq數(shù)據(jù)的文章：Transcript-level expression analy...
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關(guān)于stringtie定量基因的時(shí)候，最后輸出很多MSTRG樣式的geneid相信大家在用hisat2-stringtie-DESeq2這一套流程做差異表達(dá)基因分析的時(shí)候的時(shí)候，最后會(huì)輸出很多帶MSTRG字樣的geneid。 我一開始搜索這個(gè)問題，...
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Stringtie的使用
本文用作個(gè)人學(xué)習(xí)，全部摘抄于Stringtie說明書中文翻譯版參考鏈接：Stringtie說明書參考鏈接：Stringtie說明書中文翻譯版 StringTie的基本用法： ...
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獲取基因組的bed、gtf注釋文件先來看一下常見的基因組注釋格式 bed gtf gff 需要特別注意的是，bed的每一行記錄是左閉右開區(qū)間，并且以0作為染色體的起始；而gtf的每一行記錄是包括區(qū)間的兩端的，...
