在NGS分析入門階段，我們不需要考慮太多的細節(jié)，只用知道一個分析的大致流程并完整跑下來即可。太多的細節(jié)，只會讓我們對于分析產(chǎn)生莫須有的恐懼，因此一些“無關(guān)緊要“細節(jié)就被我們刻...
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討厭又迷人的reads去重復(fù) -
利用ssh反向代理以及autossh實現(xiàn)從外網(wǎng)連接內(nèi)網(wǎng)服務(wù)器
前言 最近遇到這樣一個問題，我在實驗室架設(shè)了一臺服務(wù)器，給師弟或者小伙伴練習(xí)Linux用，然后平時在實驗室這邊直接連接是沒有問題的，都是內(nèi)網(wǎng)嘛。但是回到宿舍問題出來了，使用校...
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SRA數(shù)據(jù)庫簡介及使用方法
來源于SRA官網(wǎng) 介紹 SRA是NIH高通量測序數(shù)據(jù)的主要存檔，并且是國際核苷酸序列數(shù)據(jù)庫協(xié)作（INSDC）的一部分，該數(shù)據(jù)庫包括NCBI序列閱讀檔案（SRA），歐洲生物信息...
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conda的安裝與使用 2.0版（2022-08-12更新）有很多的生信軟件都可以通過conda安裝，省去了很多的安裝、修bug的煩惱。經(jīng)常是安裝到崩潰的軟件，conda一行命令就搞定了。前兩天有個胖友問我gatk 3.8的版本在哪里...
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數(shù)據(jù)格式-sam和bam
1.SAM（sequence alignment map）format is a generic format for storing large nucleotide se...
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emapplot-原來能用的函數(shù)，現(xiàn)在報錯了腫么辦emapplot是富集分析可視化的一種，展示有共同基因的通路，詳見：http://www.itdecent.cn/p/c45cc2e3890f[https://www.ji...
