當(dāng)男人步入三十歲之后,身體會(huì)發(fā)生一些令人不安的變化,這些變化可能是衰老的征兆。事實(shí)上,這些變化讓人非常擔(dān)憂。三十歲是一個(gè)重要的里程碑,并且意味著進(jìn)入了成年后期階段。 另外,非...
當(dāng)男人步入三十歲之后,身體會(huì)發(fā)生一些令人不安的變化,這些變化可能是衰老的征兆。事實(shí)上,這些變化讓人非常擔(dān)憂。三十歲是一個(gè)重要的里程碑,并且意味著進(jìn)入了成年后期階段。 另外,非...
Align GVGD軟件基因突變效應(yīng)預(yù)測(cè)只能預(yù)測(cè)單個(gè)氨基酸發(fā)生變化的突變。這里以Wnt1 基因的基因突變來具體說明。 一、獲取wnt1基因的蛋白序列 1.進(jìn)入 NCBI 主頁...
我今天給大家介紹的工具是Fire Browse(http://firebrowse.org/),這是由Broad研究所開發(fā)的用于TCGA數(shù)據(jù)挖掘可視化的網(wǎng)絡(luò)平臺(tái),提供基因表達(dá)...
寫在前面 對(duì)于沒有做過共線性分析的小伙伴,可以通過以下幾段內(nèi)容,了解一下,我為什么要費(fèi)勁巴拉畫出這樣一張圖。 除了基因組成的相似性,在不同基因組中基因排列順序的一致性更能夠體...
在線工具一般具有“功能強(qiáng)大、操作簡單、無需安裝、用完就走”的特點(diǎn),輕松實(shí)現(xiàn)“用別人的服務(wù)器分析自己的數(shù)據(jù)”。 基因結(jié)構(gòu)繪制 1.Exon-Intron Graphic Mak...
簡介 今天要介紹的一款網(wǎng)頁輕工具叫NetworkAnalyst,是一個(gè)表達(dá)譜數(shù)據(jù)綜合可視化的工具。目前,該工具可對(duì)已選擇基因的ID、不同數(shù)據(jù)集基因表達(dá)矩陣、 RNAseq 和...
前言 pathview是一個(gè)通路可視化友好的R包,最主要的是它支持多組學(xué)數(shù)據(jù)映射(基因/蛋白-代謝)。自己用過它的R包,后來發(fā)現(xiàn)有網(wǎng)頁版的,果斷介紹給學(xué)員。因?yàn)椴怀S?,記錄?..
GO富集介紹每個(gè)基因都會(huì)對(duì)應(yīng)有一個(gè)或多個(gè)GO term(也就是GO功能)。富集涉及到兩個(gè)概念:前景基因和背景基因。前景基因就是你關(guān)注的要重點(diǎn)研究的基因集,背景基因就是所有的基...
最近,一直有粉絲說能否推薦好用的文獻(xiàn)翻譯軟件。既然這么多人問,說明大家對(duì)翻譯軟件的需求還蠻大。 通過搜索,我找到一款非常贊的英文翻譯軟件,可助你快速翻譯文獻(xiàn),提升文獻(xiàn)閱讀效率...
寫在前面 類似的主題,我們已經(jīng)推出了一篇主題為《一鍵完成共線性(MCScanX)分析》的文章。推出之后一部分人用著挺好。也有相當(dāng)部分朋友卻不知為何遇到各種各樣的問題。這些問題...
數(shù)據(jù)可視化都有一個(gè)共同的目的,那就是準(zhǔn)確而高效、精簡而全面地傳遞信息和知識(shí)??梢暬軐⒉豢梢姷臄?shù)據(jù)現(xiàn)象轉(zhuǎn)化為可見的圖形符號(hào),能將錯(cuò)綜復(fù)雜、看起來沒法解釋和關(guān)聯(lián)的數(shù)據(jù),建立起聯(lián)...
基因-共線性的定義與常見算法原理 物種內(nèi)的共線性分析文件準(zhǔn)備(物種比對(duì)到自身的.blast文件,物種基因信息文件.gff文件),運(yùn)行MCScanX,輸出collinear和t...
寫在前面 在很久很久以前,由于課題的需要,我寫了一個(gè)Circos圖繪制功能(在TBtools里《任何人!十分鐘掌握Circos圖繪制》)....從那以后,我就再也沒用過。這是...