發(fā)簡信
IP屬地：浙江
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2020-02-10
GSE125042+WGCNA 數(shù)據(jù)下載+預(yù)處理 數(shù)據(jù)可用，已經(jīng)是log后的數(shù)據(jù)了 WGCNA log2FPKM 提取表達矩陣 篩選sft值 選...
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2020-02-05GSE95070和GSE95426進行聯(lián)合差異基因分析 下載兩個小鼠的數(shù)據(jù)集，想對他進行聯(lián)合差異基因分析。有兩種思路，一是對各個數(shù)據(jù)集進行差異分...
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數(shù)據(jù)上傳到NCBI（不過上傳數(shù)據(jù)真的網(wǎng)要好） http://www.itdecent.cn/p/ea2cbf68a3ce https://www.jianshu...
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2019-12-30 WCGNA 2.0數(shù)據(jù)準備 按照健明老師的公眾號，進行數(shù)據(jù)準備 step2:確定最佳beta值 選擇合適“軟閥值（soft thresholding power）...
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2019-12-28學習內(nèi)容學習內(nèi)容（WCGNA） 之前在GEO數(shù)據(jù)挖掘的時候出現(xiàn)了問題，所以就去跑了一遍，又熟悉了一下流程，剛好現(xiàn)在來學習一下TCGA 基本概念 WGCN...
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2019-12-24TCGA 2.0
12/2學習內(nèi)容（TCGA 2.0） 上午 繼續(xù)閱讀關(guān)于老師發(fā)的文獻，不過這次老師發(fā)的文獻感覺有點難理解了，需要一定的知識儲備，所以閱讀的時候不...
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2019-12-2312/2學習內(nèi)容（TCGA） 整理了之前的筆記，然后再操作一下關(guān)于TCGA的數(shù)據(jù)下載，剛好用上次老師完成的對24篇文獻的處理進行處理，通過看了健...
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2019-12-2112.21Wes -seq筆記總結(jié)1 上午 wes-seq 之前跑了rna-seq的上游總結(jié)了流程，現(xiàn)在想把上周的東西整合歸納一下，在跑一遍 軟...
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2019-12-13
數(shù)據(jù)標準化（中心化+均一化） Center，就是中心化。什么是中心化呢？the variables should be shifted to b...