在看gatk4的mutect2結(jié)果時(shí)發(fā)現(xiàn)，其的AF并非是AD相加除以的結(jié)果。 One possibility is that there are reads supporti...
IP屬地：北京
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mutect2的AF（AF calculation in Mutect2）
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差異表達(dá)3｜MaGeck
MaGeck MaGeck是對CRISPR screen結(jié)果進(jìn)行篩選的軟件，差異表達(dá)的對象是sgRNA，再對不同sgRNA的結(jié)果進(jìn)行整合，得到差異基因。 1. median-...
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差異表達(dá)2｜Robust Rank Aggregation
RRA是一種對排名進(jìn)行整合，獲得一個(gè)綜合性排名列表的算法。 原始排名 -> 相對值 對于每個(gè)基因，對應(yīng)的rank vector r=(r1, ..., rn) RRA com...
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差異表達(dá)1｜edgeR和DeSeq2
edgeR/DESeq2 1. 標(biāo)準(zhǔn)化：library size/composition edgeR 1. 過濾低表達(dá)的基因 僅保留在兩個(gè)樣品或更多樣本中CPM>1的基因 C...
