請(qǐng)問一下，hommer的參考基因組除了庫中的那些，想要用其他物種怎么構(gòu)建呢？
利用HOMER預(yù)測目標(biāo)序列的motif（從運(yùn)行程序到結(jié)果解讀，以及注意事項(xiàng)）關(guān)于查找motif，目前有很多種軟件可以進(jìn)行預(yù)測。我所在的實(shí)驗(yàn)室通常使用FIMO（MEME套件里的一個(gè)），但是有很多文獻(xiàn)里也提到了HOMER這個(gè)軟件，并且不乏一些影響因子很高...
GEMMA（Genome-wide Efficient Mixed Model Association algorithm）是一款基于混合線性模型的GWAS分析軟件。相比較...
Genome sequencing reveals agronomically important loci in rice using MutMap Abstract In...
import re
import os
with open("C:/Users/radiomumm/Desktop/sucai/all+nnj.fa","r") as fa_f,open("id.txt","a") as id_w:
content=fa_f.readlines()
for i in content:
res=re.match(">",i)
if res:
id_w.write(i)
自學(xué)生信Python（第七天）|提取序列的ID提取序列的ID 本人是一枚生物學(xué)的學(xué)生，由于對(duì)生物信息學(xué)特別感興趣，于是想自學(xué)生物信息學(xué)（新手莫怪）。了解到生物信息學(xué)要有編程基礎(chǔ)，尤其是要會(huì)一門編程語言，例如：R語言、Py...
import math
def deltaG(ADP,P,ATP):
R=0.00831
T=298
G0=-30.5
deltaG=G0+R*T*math.log(ADP*P/ATP)
print(deltaG)
deltaG(1.8,5,3.5)
自學(xué)生信Python（第一天）|計(jì)算ATP水解的吉布斯自由能自學(xué)生信Python（第一天）|計(jì)算ATP水解的吉布斯自由能 本人是一枚生物學(xué)的學(xué)生，由于對(duì)生物信息學(xué)特別感興趣，于是想自學(xué)生物信息學(xué)（新手莫怪）。了解到生物信息學(xué)要有編程基...
請(qǐng)問4個(gè)樣品的vcf文件中的親本結(jié)果沒有用是為什么呢？
使用QTLseqr進(jìn)行BSA-seq分析QTLseqr是一個(gè)用于BSA-seq的R包，它能夠讀取GATK輸出結(jié)果進(jìn)行過濾，最終使用SNP-index和G 統(tǒng)計(jì)值的方法進(jìn)行定位。我們這次嘗試使用這個(gè)R包來替代我們自己...
QTLseqr包實(shí)戰(zhàn)偶然發(fā)現(xiàn)有個(gè)R包可以做相關(guān)的QTL 分析。拿來試試。 首先 安裝,參考官方文檔https://github.com/bmansfeld/QTLseqr. 第一步，如果沒有安裝...
