突然間發(fā)現(xiàn)，我一做熱圖就用pheatmap幾乎不存在第二個(gè)選項(xiàng)了。是時(shí)候跑一遍pheatmap的demo了. Examples scale是一個(gè)值得注意的參數(shù)，它旨在說明你想...
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pheatmap熱圖技巧合集 -
cutadapt 使用詳解Cutadapt安裝 基本命令 例子： 常用參數(shù) 參數(shù)詳解 Removing adapters Adapter 移除 Anchored 5’ adapters：adapter...
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NGS 數(shù)據(jù)過濾之 Trimmomatic 詳細(xì)說明
tags： Trimmomatic NGS fastq NGS 原始數(shù)據(jù)過濾對后續(xù)分析至關(guān)重要，去除一些無用的序列也可以提高后續(xù)分析的準(zhǔn)確率和效率。Trimmomatic 是...
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RNA-seq 可變剪切可變剪切定義 有些基因的一個(gè)mRNA前體通過不同的剪接方式（選擇不同的剪接位點(diǎn)）產(chǎn)生不同的mRNA剪接異構(gòu)體，這一過程稱為可變剪接(或選擇性剪接， alternative s...
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如何通過CHIP-seq分析鑒別基因啟動(dòng)子和增強(qiáng)子(活性增強(qiáng)子鑒定)學(xué)習(xí)文章：如何通過CHIP-seq分析鑒別基因啟動(dòng)子和增強(qiáng)子 - 簡書 (jianshu.com)[http://www.itdecent.cn/p/8aca72809c5...
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Minimap2（2.20）使用記錄
文章僅是記錄自己的學(xué)習(xí)使用，有錯(cuò)誤請指出，我立刻改正！ 官方說明：https://github.com/lh3/minimap2#general[https://github...
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seurat-FindAllMarkers()源碼解析現(xiàn)在回想單細(xì)胞項(xiàng)目的一些常規(guī)分析，clusters/groups間的差異表達(dá)分析（differential expression analysis）幾乎是分析必備項(xiàng)，F(xiàn)ind...
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Seurat 基礎(chǔ)知識(shí)
（一）Seurat的數(shù)據(jù)結(jié)構(gòu) 版本：3.1.5 直接輸入Seurat object的名稱，我們可以得到類似如下內(nèi)容： An object of class Seurat 13...
