問題產(chǎn)生：有一天科室?guī)熋脝枺簽槭裁次冶４娉鰜淼臄?shù)據(jù)，用excel打開后列名總是被左移了一位？有沒有解決辦法。答曰：直接在excel把他往右拖一位。師妹：可是我有二十多個這樣的...
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2020-05-22[R]write.table時列名總是左移一位？補(bǔ)幾行小代碼完美解決
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STEP6:WGCNA相關(guān)性分析因為樣本數(shù)量比較可觀，所以可以進(jìn)行WGCNA分析。這里是并不需要選取所有的基因來做WGCNA分析，挑選的標(biāo)準(zhǔn)可以是top變異程度大的基因集合，或者顯著差異表達(dá)的基因集合等等。...
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MEGA 構(gòu)建進(jìn)化樹步驟
【轉(zhuǎn)載】 分子進(jìn)化的研究對象是核酸和蛋白質(zhì)序列。研究某個基因的進(jìn)化，是用它的DNA序列，還是翻譯后的蛋白質(zhì)序列呢？序列的選取要遵循以下原則：1）如果DNA序列的兩兩間的一致度...
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跟著Nature Communications學(xué)畫圖：R語言ggplot2畫帶有底紋的柱形圖論文是 Bioactivity descriptors for uncharacterized chemical compounds 本地存儲文件名 s41467-021-2...
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R 數(shù)據(jù)可視化 —— 聚類熱圖 pheatmap前言 在前面的章節(jié)中，我們介紹了如何使用 ggplot2 繪制熱圖 ggplot2 繪制熱圖的方式很多，如 geom_raster、geom_tile 等 但通常僅僅繪制熱圖...
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用pheatmap畫熱圖
假裝是前言 學(xué)了很久的R，一直也沒啥進(jìn)展，之前一直覺得R不是很容易的東西嗎，復(fù)制粘貼代碼就好了。。emmm，太年輕太年輕。。 我用R的日常就是畫熱圖，各種各樣的熱圖。所以網(wǎng)上...
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R語言-第一次用RStudio 畫熱圖作業(yè) 1.read.table參數(shù)理解 file:文件名（包在“”內(nèi)，或者使用一個字符型變量），可能需要全程路徑（注意即使是在windows下，符號\也不允許包含在內(nèi)，必須使...
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轉(zhuǎn)錄組趨勢分析基本概念 表達(dá)趨勢分析（Series Test of Cluster）：將變化特征模式相似的基因歸類到一種變化趨勢中，從而找到實(shí)驗變化過程中最具有代表性的基因集以及對應(yīng)的趨勢...
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富集分析GO，KEGG，DO等市面上公司做RNA-Seq的一般流程是： tophat2 ---> Cufflinks ---> Cuffdiff ---> R tophat2是把reads回帖到基因組上；...
