之前寫的的CHIP-seq和RNA-seq很多練習(xí)的數(shù)據(jù)都是從GEO數(shù)據(jù)庫下載的。但是從來沒有細(xì)致的了解過GEO這個數(shù)據(jù)庫。趁著還沒復(fù)工，再多學(xué)一點(diǎn)新知識~這次的筆記是生信技...
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GEO數(shù)據(jù)庫視頻學(xué)習(xí)筆記（芯片數(shù)據(jù)下載和數(shù)據(jù)讀取） -
單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組測序解析流感病毒體內(nèi)感染2018年Cell Systems文章：Dissection of Influenza InfectionInVivoby Single-Cell RNA Sequencin...
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cellranger實(shí)戰(zhàn)2：非正常數(shù)據(jù)之僅有bam文件我所理解的cellranger軟件理想原始輸入數(shù)據(jù)就是SRA格式，然后利用sra-tools分為read、barcode+UMI、index三個fastq.gz文件。最后直接...
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ATAC-seq生信分析綜述翻譯(Genome Biology)這是目前為止我看到過的關(guān)于ATAC-seq的最新綜述，感興趣的話值得一讀。2020.4.22更新：我看到一個公眾號也翻譯了這篇文章，而且正好跟我這篇翻譯是在同一天發(fā)表http...
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Seurat學(xué)習(xí)與使用（一）簡介 ??Seurat是一個r包，被設(shè)計(jì)用于單細(xì)胞rna-seq數(shù)據(jù)的細(xì)胞質(zhì)控和分析。Seurat旨在使用戶能夠識別和解釋單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)中的異質(zhì)性來源，同時提供整合不同類型...
