前言及背景 什么是基因組de?novo測序?其是對某一物種進(jìn)行高通量測序,利用高性能計(jì)算平臺和生物信息學(xué)方法,在不依賴于參考基因組的情況下進(jìn)行組裝,從而繪制該物種的全基因組序...
前言及背景 什么是基因組de?novo測序?其是對某一物種進(jìn)行高通量測序,利用高性能計(jì)算平臺和生物信息學(xué)方法,在不依賴于參考基因組的情況下進(jìn)行組裝,從而繪制該物種的全基因組序...
關(guān)于基因組組裝的流程可以參考我的簡書:http://www.itdecent.cn/p/e02ecd537c83 前面介紹了SOAPdenovo2的使用,但是由于結(jié)果整體不...
這次用的數(shù)據(jù)是幾百個小鼠性狀的數(shù)據(jù)。 一:安裝 打開Rstudio 二:運(yùn)行 1.構(gòu)建共表達(dá)網(wǎng)絡(luò) 2.尋找最佳 β 首先確定sftpowerEstimate = 6。還有ne...
FastQC - A high throughput sequence QC analysis tool fastqc安裝 1. 下載fastqc安裝包(http://www...
前言 以這篇文章 Chromatin Accessibility-Based Characterization of the Gene Regulatory Network ...
當(dāng)二代測序的原始數(shù)據(jù)拿到手之后,第一步要做的就是看一看原始reads的質(zhì)量。常用的工具就是fastqc (http://www.bioinformatics.babraham...
利用clusterProfiler進(jìn)行富集分析時,發(fā)現(xiàn)網(wǎng)上沒有物種包OrgDb,利用網(wǎng)上教程構(gòu)建了一個。主要參考了劉小澤的簡書,特別感謝一下?。?! emapper首先得到注釋...
鍥子 去年是2018年第44周:策劃時開始著手年度總結(jié)的,相比之下,2019年晚了整一個月。最近幾日,心里也是頗不寧靜,尋尋覓覓的,好像一下子找不到存在的價值了。在今年元旦的...