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    之前在Connectivity Map(cMap)的探索應(yīng)用(二)中提到了兩種cmap在線分析網(wǎng)站,一個(gè)是build2 ;另一個(gè)是CLUE平臺(tái)。bulid2在cMAP在線分析...

  • 你好,請(qǐng)問哈新版cmap查詢后DERAILED LIST是灰色的怎么辦呢

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    cMap新版clue的使用——Morpheus

    之前在Connectivity Map(cMap)的探索應(yīng)用(二)中提到了兩種cmap在線分析網(wǎng)站,一個(gè)是build2 ;另一個(gè)是CLUE平臺(tái)。bulid2在cMAP在線分析...

  • K值確認(rèn)后,如何提取每一個(gè)聚類中有哪些樣本呢

    無監(jiān)督一致性聚類

    Consensus Clustering(一致性聚類),無監(jiān)督聚類方法,可根據(jù)不同組學(xué)數(shù)據(jù)集將樣本區(qū)分成幾個(gè)亞型,從而發(fā)現(xiàn)新的疾病亞型或者對(duì)不同亞型進(jìn)行比較分析。 Conse...

  • 請(qǐng)問如何導(dǎo)出k值確定后各個(gè)聚類中分別包含哪些樣本呢

    一致性聚類ConsensusClusterPlus

    介紹 一致性聚類是一種為確定數(shù)據(jù)集中可能的聚類的數(shù)量和成員提供定量證據(jù)的方法,例如作為微陣列基因表達(dá)。這種方法在癌癥基因組學(xué)中得到了廣泛應(yīng)用,在那里發(fā)現(xiàn)了新的疾病分子亞類。 ...

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    手把手演示R語言繪制多個(gè)基因表達(dá)值小提琴圖

    數(shù)據(jù)準(zhǔn)備 整合小提琴圖 小提琴圖DCIS VS. IBC/N 小提琴圖DCISS VS. IBCS/NS 箱線圖

  • 你好,樓主,可否分享一下KEGG pathways和弦圖的代碼呢,你這兒只分享了go和弦圖代碼

    TCGA|GEO可視化分析第2篇---KEGG|GO分析大全

    導(dǎo)讀:之前講了如何用篩選出的差異基因做做相關(guān)性分析。那今天我和各位小伙伴深入的講一下:(1)如何用clusterProfiler做KEGG|GO富集條形圖,氣泡圖;(2)如何...

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