Venn圖經(jīng)常用于表現(xiàn)組間重疊元素的數(shù)量信息。但是隨著分組數(shù)量的增多，Venn圖的結(jié)構(gòu)會越漸復(fù)雜，如下所示，當(dāng)分組數(shù)量為5組時，已經(jīng)不容易從中識別交集概況了。因此，這也是為什...
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Venn圖難以展示大于5組的集合怎么辦？用UpSet圖表示 -
主成分分析（PCA）的推導(dǎo)與解釋前言 PCA是一種無參數(shù)的數(shù)據(jù)降維方法，在機器學(xué)習(xí)中很常用，這篇文章主要從三個角度來說明PCA是怎么降維的分別是方差角度，特征值和特征向量以及SVD奇異值分解。 PCA的推導(dǎo)...
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單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)分析||Seurat新版教程:Differential expression testing
這個教程突出顯示了在Seurat中執(zhí)行差異表達(dá)式的一些示例工作流。出于演示目的，我們將使用第一個向?qū)Ы坛讨袆?chuàng)建的2700個PBMC對象。 執(zhí)行默認(rèn)的差異分析 Seurat的大...
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scikit-learn和tensorflow的區(qū)別
1、功能不同 Scikit-learn(sklearn)的定位是通用機器學(xué)習(xí)庫，而TensorFlow(tf)的定位主要是深度學(xué)習(xí)庫。一個顯而易見的不同：tf并未提供skle...
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RNA-Seq raw2fpkm pipeline (snakemake)前幾天，幫師妹分析轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)，由于她只需要FPKM，并且我剛好在學(xué)snakemake，就試著用 snakemake 寫了一個簡單的從 raw data 到 FPKM 的流程。...
