創(chuàng)建circexplorer3環(huán)境 python版本需為2.7+ 軟件版本問(wèn)題 注意：Samtools=0.1.18.0，Bowtie=1.0.0.0，tophat=2.0....
發(fā)簡(jiǎn)信
IP屬地：山東
-
CIRCexplorer3 | 踩坑之路
-
融合基因檢測(cè) tophat-fusion 報(bào)錯(cuò) "basic_exception.h:236 FAILED" 解決方案
tags： tophat-fusion tophat-fusion 報(bào)錯(cuò) RNA-seq 數(shù)據(jù)檢測(cè)融合基因，在 tophat-fusion 這一步報(bào)錯(cuò)： 第一次運(yùn)行的是 to...
-
那令人困惑的比對(duì)工具選擇啊~
寫(xiě)在前面的廢話 我可能不適合做科研，因?yàn)槲铱偸菍?duì)一些“沒(méi)有必要”的事斤斤計(jì)較~ 剛開(kāi)始接觸二代測(cè)序時(shí)，是跟著Jimmy大神從RNA-seq開(kāi)始入門(mén)的。那時(shí)候使用的比對(duì)工具是H...
-
bedtools 安裝與使用
bedtools軟件一款強(qiáng)大的基因組數(shù)據(jù)處理工具集，如序列提取，合并，拆分等 1、軟件的安裝兩種方式 第一種下載軟件安裝，進(jìn)入到自己存放軟件的文件夾 下載完后解壓 mkae ...
-
[轉(zhuǎn)載]RNAseq: TopHat2 + Cufflinks分析流程
[轉(zhuǎn)載]RNA-seq :TopHat2 + Cufflinks分析流程 測(cè)序數(shù)據(jù)質(zhì)量控制：fastqc軟件 使用方法： 參數(shù)說(shuō)明：-o: 輸出文件所在目錄，并且是已經(jīng)存在的...
-
Hisat2 安裝hisat2的安裝 1.下載 運(yùn)行結(jié)果 2.解壓 結(jié)果 一般源代碼安裝需編譯后再安裝，編譯前需要檢查配置，即執(zhí)行./configure命令來(lái)完成，但hisat2不需要執(zhí)行./...
-
2018-06-15 如何加快（一點(diǎn)點(diǎn)）從NCBI上下載數(shù)據(jù)的速度
之前要下載一個(gè)大數(shù)據(jù)，從NCBI上下載比較慢，聽(tīng)了洲更建議，我就去ENA上下載，確實(shí)，下載很人性化，而且還有一個(gè)java的下載器，速度快，還方便選擇。 但是，最近我突然無(wú)法從...
-
如何在NCBI下載數(shù)據(jù)（包括批量下載）？NCBI（National Center for Biotechnology Information）https://www.ncbi.nlm.nih.gov/[https:...
-
對(duì)抗樣本之FGSM原理&實(shí)戰(zhàn)
目錄1、FGSM原理2、pytorch實(shí)現(xiàn)2.1 建立模型2.2 FGSM模塊2.3 測(cè)試2.4 可視化對(duì)比2.5 對(duì)比樣本與對(duì)抗樣本 1、FGSM原理 論文 Explain...
