作者：白介素2相關(guān)閱讀：[R語言生存分析03-Cox比例風(fēng)險(xiǎn)模型]R語言生存分析-02-ggforestR語言生存分析-01ggpubr-專為學(xué)術(shù)繪圖而生（二）ggstats...
IP屬地：天津
-
R語言生存分析03-Cox比例風(fēng)險(xiǎn)模型 -
R語言 畫生存曲線圖做生存分析菜鳥終于做到生存分析了。 首先準(zhǔn)備好你的數(shù)據(jù)，數(shù)據(jù)最重要的兩大要點(diǎn)：1要有生存時(shí)間time2要有事件的狀態(tài) 截尾or死亡 看一下我準(zhǔn)備的數(shù)據(jù) head(d)ID time s...
-
RobustRankAggreg分析胃癌差異基因目的：下載GSE19826、GSE33335、GSE56807、GSE63089這四個(gè)GSE數(shù)據(jù)集，分別在每個(gè)數(shù)據(jù)集里求出差異表達(dá)基因，最后用RobustRankAggreg...
-
GEO/TCGA數(shù)據(jù)是否需要標(biāo)準(zhǔn)化的問題一.對于芯片數(shù)據(jù)： GEO中的Series Matrix File(s)通常是經(jīng)過了標(biāo)準(zhǔn)化和對數(shù)轉(zhuǎn)換的數(shù)據(jù)，但是不是所有的都是 具體判斷方法： 表達(dá)量是否需要重新標(biāo)準(zhǔn)化： 可...
-
R語言畫韋恩圖的一個(gè)小例子~ggvenn韋恩圖是用來展示不同組數(shù)據(jù)間交集和差異的一種可視化方法。比如我們有三組數(shù)據(jù)，分別是A，B，C。A里的數(shù)據(jù)是1,2,3。B里的數(shù)據(jù)是2,3,4。C里的數(shù)據(jù)是3,4,5,。那么A...
-
GEO數(shù)據(jù)挖掘小嘗試：（一）尋找共同差異基因在使用Bioconductor 分析芯片數(shù)據(jù)（一）中我們使用的是芯片的原始數(shù)據(jù)（即*.cel文件）進(jìn)行分析，但在大部分情況下我們是可以利用GEO數(shù)據(jù)庫中已有的表達(dá)矩陣來進(jìn)行數(shù)...
-
GEO數(shù)據(jù)庫：GEO2R的簡單使用今天聽了一節(jié)關(guān)于GEO數(shù)據(jù)庫的課，GEO是什么，又是一頭霧水，強(qiáng)迫基因受環(huán)境影響出現(xiàn)短暫的表達(dá)，趕緊搜索了解下，GEO（Gene Expression Omnibus dat...
-
GO，KEGG，DO富集分析這是我聽B站鯪魚不會飛視頻（GO，KEGG，DO富集分析）里的筆記哦~當(dāng)然有的地方加上的是我自己的理解，如果哪里和視頻上講的不一樣那是我自己發(fā)揮的，自行忽略.... 市面上公...
