多組學流程開發(fā)
IP屬地：海南
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MSKCC Research Associate<br>別趕不上野心，又辜負了努力
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要有自己的筆記，不能就這樣把PPT放上來
四、Linux之shell腳本編程
1.Linux系統(tǒng)環(huán)境 2.變量 3.結構化語句 (1)if語句 (2)while語句 參數(shù)擴展3.2.9 4.Shell腳本編程 任務提交
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這是舊版本的了，新版本conda安裝后不再這這樣
linux安裝或卸載miniconda
Conda 是一個開源的軟件包管理系統(tǒng)和環(huán)境管理系統(tǒng)，用于安裝多個版本的軟件包及其依賴關系，并在它們之間輕松切換。 1.安裝conda 瀏覽器搜索 miniconda 清華 ...
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對bed文件有些疑問，對于外顯子測序，真的使用這個文件嗎
8 比對及找變異步驟的質控
使用qualimap對wes的比對bam人家總結測序深度和覆蓋度 1 比對的各個階段的bam進行質控 可以把中間生成的.bam文件刪除，就是帶marked的bam文件 安裝b...
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@NICE_AGIS 如果你測試OK，那就用自己的方法
samtools的安裝和使用
--------------- Nickier 2018-12-21 --------------- samtools是一個用于操作sam和bam文件的工具合集。能夠實現(xiàn)二進...
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直接刪除這一行就好
關于外顯子坐標文件的一個問題
今天在跑gatk call variant的時候，報了這樣的一個錯誤 報錯信息說：坐標文件中有一個位置的終止坐標69716217，而起始坐標是69716218，也就是說終止坐...
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要不要出個工具合集。。。雖然網(wǎng)站也能用，但是學了生信就只想用R或Linux了
SNP功能注釋網(wǎng)站合集
這篇文章是對SNP位點功能注釋在線網(wǎng)站的一個總結帖。 軟件排名不分先后，優(yōu)先順序可以看推薦指數(shù)。 彩蛋在最后，請堅持看完 1、GWAS4D, 推薦指數(shù)：**** 網(wǎng)址：htt...
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關于mac電腦連接服務器掉線的解決方法
是在mac的家目錄里面.ssh添加多一個config 然后寫入這下面幾行行 然后回車，新起一行，按一下 Ctrl C 結束，最后重新登錄服務器即可
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非常感謝你的反饋，我會仔細檢查一遍，更新后再發(fā)布
用picard制作外顯子坐標文件
--------------- Nickier 2018-12-07 --------------- 第一次用picard，不知道怎么用，先用conda安裝了一個 找到需要的...
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linuc系統(tǒng)與工具
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上游分析結合數(shù)據(jù)好好理解一下，每一步都做了什么，數(shù)據(jù)背后的生物學意義又是什么
RNA-seq實戰(zhàn)分析流程
一、下載測序數(shù)據(jù) ①SRA數(shù)據(jù)庫[存儲二代測序的原始數(shù)據(jù)]②在進行上游分析時，數(shù)據(jù)格式轉換過程概述如下：sra↓FASTQ↓bam↓counts③質控處理的相關軟件：? fa...
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@魚嘯九天 謝謝，希望能幫到你
一文理解環(huán)境變量
一文理解環(huán)境變量 對于Linux初學者來說，環(huán)境變量是個很陌生的名詞，很多人不能理解它是到底是什么，可以用來干嘛。其實，環(huán)境變量，在windows中也有，只是我們平時不怎么直...
