作者，追風(fēng)少年i 新的一周，新的開始，接上一篇，10X空間轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)分析之細(xì)胞的空間依賴性[http://www.itdecent.cn/p/1877c6688948]，這...
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10X空間轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)分析之細(xì)胞類型與生物學(xué)通路的空間依賴性 -
10X空間轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)分析之細(xì)胞百分比餅圖的繪制作者，追風(fēng)少年i 最近一直有人問我空間轉(zhuǎn)錄組的餅圖該如何繪制，如下圖 之前呢，說過一些，大家可以借鑒 10X空間轉(zhuǎn)錄組繪圖之細(xì)胞類型百分比餅圖和空間密度分布圖[https:/...
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R語言代碼-繪制SCI發(fā)表級的nomogram及calibration圖需求描述 畫出paper里的nomogram圖和校準(zhǔn)曲線 出自https://linkinghub.elsevier.com/retrieve/pii/S1470-2045(...
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復(fù)現(xiàn)：純R代碼實現(xiàn)ssGSEA算法評估腫瘤免疫浸潤程度最近學(xué)習(xí)了生信菜鳥團(tuán)的純R代碼實現(xiàn)ssGSEA算法評估腫瘤免疫浸潤程度,想復(fù)制作者的流程，但是發(fā)現(xiàn)了幾個不一樣的地方，所以重新整理流程，代碼主要來自原作者Juan_NF。 文...
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生存分析的R筆記基本概念 生存分析：從字面上就是讓我們分析事件發(fā)生的速率，研究各個因素與生存時間有無關(guān)系及關(guān)聯(lián)程度大小。主要描述3個內(nèi)容： 1.研究生存過程 研究生存時間的分布特點，估計生存...
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TCGA甲基化數(shù)據(jù)下載以及相關(guān)臨床信息整理之前的文章里已經(jīng)按照教程進(jìn)行了TCGA數(shù)據(jù)庫的一些練習(xí)（RNA-seq、芯片、生存分析），現(xiàn)在學(xué)習(xí)TCGA甲基化數(shù)據(jù)的分析過程。 參考文章：1.甲基化的一些基礎(chǔ)知識2.Mak...
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R數(shù)據(jù)科學(xué)之日常積累劉小澤開始寫于18.9.4晚，這必定是一個持續(xù)性更新的過程昨天jimmy一發(fā)朋友圈，單篇閱讀量很快超過了我們的關(guān)注人數(shù)??開心之余，今晚拿起了數(shù)據(jù)科學(xué)這本書看了起來～正如書的安...
