流行病學(xué)研究常見的分析就是相關(guān)性分析了。 相關(guān)性分析某種程度上可以為我們提供一些研究思路,比如缺乏元素A與某種癌癥相關(guān),那么我們可以通過補(bǔ)充元素A來減少患癌率。這個(gè)結(jié)論的大前...
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前言 對(duì)于很多小伙伴來說,剛?cè)胧稚艜r(shí)接觸最多的就是差異分析,即在基因組層面可以算突變率差異,轉(zhuǎn)錄組層面可以算基因表達(dá)水平差異,表觀組可以觀察甲基化水平差異,蛋白質(zhì)組/代謝組...
有哪些方法可以用于評(píng)判腫瘤免疫浸潤(rùn) 方法很多,這里先選個(gè)簡(jiǎn)單一點(diǎn)MCPcounter,GEO和TCGA數(shù)據(jù)都可以分析,更重要的是因?yàn)榘伟俨?. = MCPcounter 加...
tableone是幫助我們快速生成文章中table1表格的一個(gè)包,通常來說一篇SCI文章的第一個(gè)表都會(huì)給出樣本的基線情況。而tableone就是可以幫我們快速地匯總描述所有樣...
只要學(xué)習(xí)過數(shù)據(jù)分析,或者對(duì)數(shù)據(jù)分析有一些簡(jiǎn)單的了解,比如使用過SPSSAU、SPSS這些統(tǒng)計(jì)分析軟件,都知道有回歸分析。按照數(shù)學(xué)上的定義來看,回歸分析指研究一組隨機(jī)變量(Y1...
相比于網(wǎng)頁工具,使用編程語言處理科研數(shù)據(jù)的一大優(yōu)勢(shì),在于高度的定制化,以及批量處理數(shù)據(jù)的快捷性和高效性 目錄批量處理——for循環(huán)批量計(jì)算組間差異[https://www.j...
臨床預(yù)后模型,大多包含風(fēng)險(xiǎn)分層和獨(dú)立預(yù)后分析兩個(gè)驗(yàn)證分析,而很多文章在兩個(gè)分析上存在不嚴(yán)謹(jǐn)。下面介紹一些分析的關(guān)鍵點(diǎn)。 1. 風(fēng)險(xiǎn)分層與cutoff 一般而言,預(yù)后模型會(huì)有訓(xùn)...
CIBERSORT的注意事項(xiàng) CIBERSORT的使用,我們舉了幾個(gè)例子,但是還有一些疑問,只要有疑問在,就感覺心里不踏實(shí)。比如:1.CIBERSORT需要什么樣的數(shù)據(jù)?是芯...