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發(fā)簡(jiǎn)信
IP屬地：上海
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【10X空間轉(zhuǎn)錄組Visium】（三）跑通Visium全流程記錄 -
R語言分析微生物組數(shù)據(jù)代碼示例大全寫完這篇推薦信小編可以回家放心過年了，不，是回家生兒育女頤養(yǎng)天年。本文推薦的幾款微生物組（擴(kuò)增子、宏基因組）的數(shù)據(jù)分析示例網(wǎng)站（pipeline、workshop）進(jìn)一步降低...
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SAMtools: SAM格式的處理利器SAM及其相關(guān)工具 SAM格式介紹 SAM全稱是Sequence Alignment/Map, 是目前最常用的存放比對(duì)或聯(lián)配數(shù)據(jù)的格式。無論是重測(cè)序，還是轉(zhuǎn)錄組，還是表觀組，...
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DESeq2的baseMean和log2FoldChange是如何得到的？
有一個(gè)朋友問了我一個(gè)問題，DESeq2的baseMean是如何計(jì)算？我最初都是認(rèn)為baseMean計(jì)算的是對(duì)照組的樣本標(biāo)準(zhǔn)化counts的均值。由于我在分析結(jié)果里還會(huì)提供所有...
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系統(tǒng)進(jìn)化分析全記錄——以HDZIP3家族為例（附自動(dòng)化phylogeny程序）
一、phylogeny總體分析流程 系統(tǒng)進(jìn)化分析已經(jīng)是做生物學(xué)、生物信息的一項(xiàng)基礎(chǔ)分析方法了。確定同源基因、進(jìn)化歷史、基因家族分析、分子進(jìn)化等都需要這一技能?？傮w來說，系統(tǒng)進(jìn)...
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老板親自傳授的文獻(xiàn)閱讀方法前言 論一個(gè)氣場(chǎng)合適的導(dǎo)師的重要性。想起一個(gè)微信朋友前截圖 A：導(dǎo)師牛不牛，師兄師姐牛不牛，跟你牛不牛沒有關(guān)系 B：你錯(cuò)啦，導(dǎo)師牛不牛，師兄師姐牛不牛，很大程度上決定我牛不牛...
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基因組survey基因組survey 在組裝基因組之前一定要先對(duì)要組裝的物種有一個(gè)大致的了解，判斷其復(fù)雜程度, 標(biāo)準(zhǔn)如下 基因組大?。夯蚪M越大，測(cè)序花的錢越多 簡(jiǎn)單基因組: 雜合度低于0.5...
