標題： Single-cell RNA landscape of intratumoral heterogeneity and immunosuppressive micro...
發(fā)簡信
IP屬地：貴州
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文獻復現(xiàn)01（GSE152048）：01-數(shù)據下載 -
2024-09-26 服務器上安裝Seurat
Seurat 4.？升級Seurat5報錯 lazy loading failed for package 'Seurat' 報錯 lazy loading failed f...
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【2024-01-05】用python解決小學幾何題老婆發(fā)了道題過來，想解釋的話，畫圖是最明顯的吧，就用python的turtle模塊試試咯。 效果還不錯，就是用三角函數(shù)算邊長半徑花了點時間。 把問題丟給了chatGPT 跟著...
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淺淺的學習歷程<br>生信新手，打工人，搬運工。<br>像王子文一樣財務自由，才可實現(xiàn)生育自由<br>像李子柒一樣把一件事情做到極致，才可實現(xiàn)職業(yè)自由
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【施工中】常用數(shù)據庫下載參考基因組及注釋文件參考：Jimmy老師博客：基因組各種版本對應關系目前常用的人類參考基因組是GRCh37和GRCh38，在三大常用數(shù)據庫對應關系如下： NCBIUCSCENSEMBLGRCh3...
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第2周：RNA-seq數(shù)據分析最佳實踐原文來源：Conesa A, Madrigal P, Tarazona S, et al. A survey of best practices for RNA-seq da...
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【不定期更新】Bedtools大全--42個子命令介紹參考鏈接： 用法大全: 官方說明：https://bedtools.readthedocs.io/en/latest/content/overview.htmlBedtool...
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2020-05-08 復現(xiàn)GSE137675 RNA-Seq結果(2)：下游分析將上游分析最后得到的counts.txt讀入到R中 讀入作者上傳的表達矩陣GSE137675_Reads_count_featureCounts.xlsx，并跟自己處理的結果...
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2020-05-08 復現(xiàn)GSE137675 RNA-Seq結果(1)：上游分析創(chuàng)建項目 下載原始FastQ數(shù)據 1.1 使用循環(huán)創(chuàng)建下載地址文件 1.2 編寫批量下載腳本aspera.sh 1.3 運行腳本aspera.sh批量下載FastQ文件 對原...
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單樣本基因集富集分析 --- ssGSEA1. 概述 單樣本基因集富集分析（single sample gene set enrichment analysis, ssGSEA），是GSEA方法的擴展，主要是針對單個...
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RNA-seq 數(shù)據分析最佳實戰(zhàn)（綜述）知識的學習沒有一蹴而就，沒有捷近，扎實的學習是唯一的捷近。 一篇RNA-seq分析流程的綜述，全面而詳細！深度好文，可用來反復閱讀。初學者用于把握RNA-seq真?zhèn)€流程及各個...
