前言 只有光頭才能變強(qiáng) 這個學(xué)期開了Linux的課程了，授課的老師也是比較負(fù)責(zé)任的一位。總的來說也算是比較系統(tǒng)地學(xué)習(xí)了一下Linux了~~~ 本文章主要是總結(jié)Linux的基礎(chǔ)...
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看完這篇Linux基本的操作就會了
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R語言設(shè)置write.table()輸出的文件格式
write.table()，是保存數(shù)據(jù)為文件的函數(shù)。 得到的1234.txt，打開是這個樣子： "x"是列名，"1","2","3"是行名。不輸出列名、行名和代表字符串的雙引...
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RNA-seq(2)-1:原始數(shù)據(jù)下載的幾種方法
How to download All Sra data At Once SRA: Sequence Read Archive: It belongs to NCBI (N...
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ATAC-seq講座視頻筆記系列筆記基于達(dá)澈生物講座視頻，從中初步學(xué)習(xí)了解生信分析中常遇到的組學(xué)分析技術(shù)。ChIP-seq和 CUT&Tag、CUT&RUN講座視頻筆記 - 簡書 [https://w...
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「工具」使用BETA整合分析ATAC-seq/ChIP-seq和RNA-seq數(shù)據(jù)BETA 網(wǎng)址: http://cistrome.dfci.harvard.edu/BETA/tutorial.html 功能介紹 數(shù)據(jù)準(zhǔn)備： peak bed file d...
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轉(zhuǎn)載ATAC-Seq、ChIP-Seq、RNA-Seq整合分析
轉(zhuǎn)自：生信技能樹這是目前發(fā)現(xiàn)不錯的ATAC系列，原作者在簡書也有更新http://www.itdecent.cn/u/d5b900bea027 ATAC系列連載： ATAC...
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R語言 -- 交并補(bǔ)：intersect、union、setdiff、Reduce多重操作
R語言 -- 交并補(bǔ)：intersect、union、setdiff、Reduce多重操作
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提取 genecode的gtf注釋信息
讀入數(shù)據(jù) 提取gene信息 獲取想要的信息 寫在最后的話 很多大神用perl和python來提取，對于文本提取這兩個語言有很大的優(yōu)勢，不過需要花時間取理解。平時常用R，同時實(shí)...
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Volcano plot | 別再問我這為什么是火山圖
火山圖是散點(diǎn)圖的一種，它將統(tǒng)計測試中的統(tǒng)計顯著性量度（如p value）和變化幅度相結(jié)合，從而能夠幫助快速直觀地識別那些變化幅度較大且具有統(tǒng)計學(xué)意義的數(shù)據(jù)點(diǎn)（基因等）。常應(yīng)用...
