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    snpEff注釋變異位點(diǎn)信息

    SnpEff是一種變體注釋和效果預(yù)測工具,它注釋和預(yù)測遺傳變異的影響(例如氨基酸變化)。 1. 軟件安裝 2. 運(yùn)行 2.1 構(gòu)建SnpEff數(shù)據(jù)庫 SnpEff軟件的運(yùn)行,...

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    系統(tǒng)學(xué)習(xí)單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組測序scRNA-Seq(四)

    劉小澤寫于19.3.26陌生的領(lǐng)域就像一張白紙,怎么畫就看自己了 前言 關(guān)于單細(xì)胞測序,我們已經(jīng)知道了它和bulk RNA-seq的區(qū)別,簡單說就是scRNA體現(xiàn)異質(zhì)性(個(gè)體...

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    Vim入門基礎(chǔ)

    公司新員工學(xué)習(xí)有用到,Vim官網(wǎng)的手冊又太大而全,而網(wǎng)上各方資料要么不全面,要么不夠基礎(chǔ)。在網(wǎng)上搜集各方資料,按照自己的框架整理一份Vim入門基礎(chǔ)教程,分享出來。特點(diǎn)是偏向基...

  • Linux下查看磁盤剩余空間和文件夾大小

    df命令是[linux](javascript:;)系統(tǒng)以磁盤分區(qū)為單位查看文件系統(tǒng),可以加上參數(shù)查看磁盤剩余空間信息,命令格式:df -hl顯示格式為:文件系統(tǒng) ...

  • 使用awk將文件中的某列替換為另一文件中的某列

    兩個(gè)文件,如何將f1中第2列替換為f2中第3列 awk代碼實(shí)現(xiàn)如下 上述代碼的說明: FNR == NR允許您一次處理一個(gè)完整的文件.在這種情況下,它是文件f2. NR和FN...

  • R中實(shí)現(xiàn)excel中vlookup功能

    R中實(shí)現(xiàn)vlookup功能可分為兩種情況:1.同一數(shù)據(jù)框(data.frame)中匹配兩列變量,并創(chuàng)建新變量 2.匹配兩個(gè)數(shù)據(jù)框則使用merge函數(shù)

  • Linux中批量壓縮文件夾

    'find ./* -type d' 表示查找所有文件夾,-type d就表示指定文件夾類型,這種方法是把每個(gè)文件夾單獨(dú)壓縮,一個(gè)文件夾對應(yīng)一個(gè)壓縮包 或者 這是把多個(gè)文件夾...

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    臨床生物信息學(xué)中的GWAS分析

    今天要分享的是一本合集Clinical Bioinformatics臨床生物信息學(xué)實(shí)驗(yàn)指南中的第五章Bioinformatics Challenges in Genome-W...

  • linux中給文件增加一列行號

    $0=NR表示給文件賦值行號," " 表示行號與文件其他內(nèi)容的分割符,最后一個(gè)$0表示文件其他內(nèi)容

  • awk打印指定行列

    NR表示行;NF表示瀏覽文件域的個(gè)數(shù)(可以按列去理解);注意$NF表示文件最后一個(gè)域

  • Linux中批量提取多個(gè)文件指定行至新文件

    提取同一文件夾下多個(gè)文件 注意此處不能用單>,因?yàn)?gt;表示先清空文件再寫入。>會(huì)造成只有一個(gè)文件的結(jié)果被保留,所以要用>>

  • linux中查看文件及文件夾大小

    查看文件夾下所有文件大小 獲取文件夾下所有文件名

  • linux中批量解壓.gz壓縮文件

    利用for循環(huán),注意shell中for循環(huán)寫法與R不同

  • linux中在任意目錄下調(diào)用安裝軟件

    將軟件的安裝位置加入PATH環(huán)境變量 echo $PATH 顯示PATH值 PATH=$PATH:軟件安裝路徑

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