上周的暑期生信黑馬培訓(xùn)有老師提出要做SOM分析,最后卡在code plot只能出segment plot卻出不來line plot。查了下,沒看到解決方案。今天看了下源碼,設(shè)...
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還有問題想請教博主!我按照你的筆記進(jìn)行操作,在寫supersom函數(shù)時(shí)出現(xiàn)錯(cuò)誤,Error in remove.data.na(data, narows) : Empty data layer - check maxNA.fraction argument,是說出現(xiàn)空數(shù)據(jù)層嗎?應(yīng)該怎么解決,求指導(dǎo)!
SOM基因表達(dá)聚類分析初探上周的暑期生信黑馬培訓(xùn)有老師提出要做SOM分析,最后卡在code plot只能出segment plot卻出不來line plot。查了下,沒看到解決方案。今天看了下源碼,設(shè)...
@生信寶典 謝謝博主的回復(fù)!
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想請教一下博主,利用SOM對轉(zhuǎn)錄組進(jìn)行分析時(shí),3個(gè)生物學(xué)重復(fù)是必須的嗎?只對一個(gè)樣本進(jìn)行分析得出的結(jié)論是否有意義?
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基本操作 讀取本地?cái)?shù)據(jù) 設(shè)置行名,列名 數(shù)據(jù)框?qū)С?變量保存與加載 提取元素 直接使用數(shù)據(jù)框中的變量 保存作圖 不同后綴的圖用不同的圖,如: pdf("0118.pdf") ...