PopSizeABC的原理:1.根據(jù)觀測數(shù)據(jù)(真實數(shù)據(jù))估算SFS和LD2.考慮了大量隨機種群歷史變化情景。對于每個歷史變化情景,都會模擬許多序列。這些序列可以反映相應的歷史...
PopSizeABC的原理:1.根據(jù)觀測數(shù)據(jù)(真實數(shù)據(jù))估算SFS和LD2.考慮了大量隨機種群歷史變化情景。對于每個歷史變化情景,都會模擬許多序列。這些序列可以反映相應的歷史...
https://blog.csdn.net/LuohenYJ/article/details/97950522[https://blog.csdn.net/LuohenYJ/...
寫在前面:當學習某一重要文件格式時,更需要對此格式對應軟件工具進行全面的學習(如sam/bam——samtools)。在多次花時間寫腳本處理文件之后發(fā)現(xiàn),80%左右的任務其實...
根據(jù)染色體提取vcf中的信息: bcftools view -r chr20,chr21,chr22 NA12878.vcf.gz -o NA12878.vcf.chr20_...
https://zhuanlan.zhihu.com/p/172499071[https://zhuanlan.zhihu.com/p/172499071]
http://www.itdecent.cn/p/f9c948a6c7de[http://www.itdecent.cn/p/f9c948a6c7de]
https://zhuanlan.zhihu.com/p/65720484[https://zhuanlan.zhihu.com/p/65720484]
https://www.cnblogs.com/zhanmaomao/p/12487349.html[https://www.cnblogs.com/zhanmaomao/p...
https://blog.csdn.net/Gossie/article/details/109320960[https://blog.csdn.net/Gossie/art...
https://cloud.tencent.com/developer/article/1720656[https://cloud.tencent.com/developer...
關于為何要進行SNP的過濾: 第一,低質(zhì)量和無信息的SNP會影響后續(xù)群體結(jié)構(gòu)或GWAS的分析結(jié)果,甚至影響后續(xù)對生物學問題的解釋;第二,群體研究時,由于測序的個體較多檢測出來...
https://blog.gtwang.org/linux/singularity-3-installation-and-usage-tutorial/[https://bl...
https://ming-lian.github.io/2019/02/08/call-snp/[https://ming-lian.github.io/2019/02/08...
GATK4 流程分析- 從fastq到vcf - Beccaliii的文章 - 知乎https://zhuanlan.zhihu.com/p/69726572[https:/...
問題描述 在生物信息分析過程中,常常需要修改 vcf 染色體名稱,即刪除染色體名中的chr字符或添加chr字符到vcf文件中。 這里使用shell腳本和bcftools兩種方...