數(shù)據(jù)類型 輸出結(jié)果
發(fā)簡信
IP屬地：四川
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群體進化-GWAS分析
群體進化-gwas分析 群體進化基礎(chǔ)分析 PCA 分析原理PCA(Principal Component Analysis)，即主成分分析方法，是一種使用最廣泛的數(shù)據(jù)...
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SnpEff使用方法
SnpEff使用方法 SnpEff 軟件通過基因組結(jié)構(gòu)注釋數(shù)據(jù)（GTF文件），對VCF文件中的SNP/InDel信息進行注釋，即主要解釋了SNP/InDel是否能夠?qū)幋a蛋白...
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[基因組學(xué)]使用GAMP根據(jù)已知CDS序列來進行未知基因組序列的功能注釋
GMAP最早用于講EST/cDNA序列比對到參考基因組上，可以用于基因組結(jié)構(gòu)注釋。后來高通量測序時代，又開發(fā)了GSNAP支持高通量數(shù)據(jù)比對。 軟件安裝 我采用的是利用源代碼且...
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基因家族專題(3)：基因家族成員的鑒定
Data preparation 繼續(xù)上次的內(nèi)容，下載好數(shù)據(jù)后就可以正式開始鑒定了。首先回顧一下，下載好的數(shù)據(jù)。 基因組序列信息，存儲基因組序列信息的.fasta文件。還有其...
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Markdown基本語法Markdown是一種純文本格式的標(biāo)記語言。通過簡單的標(biāo)記語法，它可以使普通文本內(nèi)容具有一定的格式。 相比WYSIWYG編輯器 優(yōu)點：1、因為是純文本，所以只要支持Markd...
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關(guān)于SNP的過濾（1）：如何使用vcftools進行SNP過濾
前言 很多關(guān)注我這個專題的朋友都在后臺留言，說想了解更多關(guān)于SNP過濾的東西。是的，確實這是一個比較重要的問題。第一，過濾到一些低質(zhì)量的SNP可以防止calling一些假陽性...
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ATAC-seq分析實操生信技能樹健明教程放在最前面的參考鏈接：給學(xué)徒的ATAC-seq數(shù)據(jù)實戰(zhàn)（附上收費視頻) 數(shù)據(jù)來源的文章： The landscape of accessible chromatin in m...
