這是我聽孟浩巍知乎LiveB站鯪魚不會飛視頻（轉(zhuǎn)錄組分析進(jìn)階課程）里的筆記哦~ 本次知乎Live解決的問題： 轉(zhuǎn)錄組的建庫與質(zhì)量控制 人類基因組與轉(zhuǎn)錄組組成 轉(zhuǎn)錄組的2種建庫...
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轉(zhuǎn)錄組分析進(jìn)階 -
四. 基因組數(shù)據(jù)可視化(BWA, Minimap2, samtools and IGV)一. 簡介 在基因組數(shù)據(jù)分析過程中，我們可以將fastq，fasta，ONT等不同格式的數(shù)據(jù)mapping到參考基因組上，然后通過IGV進(jìn)行可視化，結(jié)合GFF3文件手工對感興...
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hisat2比對轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)
目前hisat2是最流行的轉(zhuǎn)錄組比對軟件，其比對速度快，且準(zhǔn)確度較高。具體使用方法如下：用到的軟件版本為hisat2-2.2.1，samtools-1.6 1. 構(gòu)建hisa...
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RNAseq常規(guī)流程轉(zhuǎn)錄組分析是生信分析的一個基礎(chǔ)和常見的分析流程，一般從下機(jī)數(shù)據(jù)開始，經(jīng)過一系列的質(zhì)控，基因組比對，差異分析等過程得到實(shí)驗(yàn)組與對照組（或者腫瘤中的轉(zhuǎn)移組和原癌組）中差異表達(dá)的基...
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RNAseq高級分析有哪些學(xué)習(xí)筆記
好久沒有學(xué)習(xí)RNAseq的東西了，今天隨意翻到一篇很不錯的總結(jié)，這里了只是我的學(xué)習(xí)筆記，原文會更好一些：https://mp.weixin.qq.com/s/u_ZC7wsC...
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轉(zhuǎn)Linux學(xué)習(xí)之路之首次了解Linux并且嘗試Linux學(xué)習(xí)之初 學(xué)習(xí)目的，換做是以前，我只單純的對Linux系統(tǒng)感興趣，但是現(xiàn)在看到Linux運(yùn)維的前景很可觀，而我現(xiàn)在也非常想要跳出現(xiàn)在枯燥的工作，并且需要更好的收入提高自己的生...
