轉(zhuǎn)錄組測(cè)序目前主要有兩種形式,RNA-seq和microarry。這兩種技術(shù)產(chǎn)生的數(shù)據(jù)在GEO數(shù)據(jù)庫(kù)中都有很多,其中RNA-seq的數(shù)據(jù)大多是已經(jīng)注釋過(guò)的symbol為行名的...
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相信很多科研工作者(不包括比我厲害的大佬們)在做轉(zhuǎn)錄組時(shí),都是在公司做測(cè)序,然后數(shù)據(jù)也交給公司分析,又然后,期待做個(gè)差異分析,得出像下圖那么完美的熱圖。 然而,然而,,我們得...
最近聽說(shuō)定量免疫浸潤(rùn)很火,于是我也報(bào)名參加了果子老師的課程,跑了幾個(gè)R包,你比如說(shuō)xCell啊,GSVA啊,MCPcounter啊,ConsensusTME,ImmuneSu...
測(cè)序上游分析系列: mRNA-seq轉(zhuǎn)錄組二代測(cè)序從raw reads到表達(dá)矩陣:上中游分析pipelinemiRNA-seq小RNA高通量測(cè)序pipeline:從raw r...