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發(fā)簡(jiǎn)信
IP屬地：廣東
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那令人困惑的比對(duì)工具選擇啊~
寫在前面的廢話 我可能不適合做科研，因?yàn)槲铱偸菍?duì)一些“沒有必要”的事斤斤計(jì)較~ 剛開始接觸二代測(cè)序時(shí)，是跟著Jimmy大神從RNA-seq開始入門的。那時(shí)候使用的比對(duì)工具是H...
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再探sort命令
起因 之前只知道sort命令可以對(duì)文本排序，用選項(xiàng)-t指定分隔符，用-k指定排序字段，用-n指定字段為數(shù)字。但是由于實(shí)戰(zhàn)機(jī)會(huì)較少，真正操練起來的時(shí)候，發(fā)現(xiàn)捉襟見肘，可以參見下...
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NCBI數(shù)據(jù)庫Fastq原始序列上傳和登錄號(hào)獲取最近文章要求原始數(shù)據(jù)上傳NCBI數(shù)據(jù)庫，小白摸索了一路總算有了點(diǎn)認(rèn)識(shí)哈哈~寫下來當(dāng)做筆記。 1.賬號(hào) 首先我們要登錄NCBI網(wǎng)站，見圖1右上角，如果有賬號(hào)直接登陸就好。沒有的...
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生信log7|用barrnap在細(xì)菌全基因組中抽取16sr RNA 序列
使用軟件：barrnap（需要在合適的環(huán)境中配合運(yùn)行） barrnap其實(shí) 除了自己一個(gè)文件以外，還會(huì)配合bedtools來抽取fasta中的序列，否則會(huì)因?yàn)楦袷絾栴}報(bào)錯(cuò)而不...
