使用conda 導(dǎo)出的yaml,可以使用下面的命令快速安裝配置三代全長轉(zhuǎn)錄組分析工作環(huán)境smrtlink
發(fā)簡信
IP屬地：山西
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比較基因組學(xué)分析3：特異節(jié)點(diǎn)基因家族富集分析（非模式物種GO/KEEG富集分析）比較基因組學(xué)分析目錄 1：單拷貝基因構(gòu)建物種樹以及計(jì)算分化時(shí)間[http://www.itdecent.cn/p/10bb4410ae3d]2：基因家族收縮與擴(kuò)張分析[ht...
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您好 私信發(fā)不了呢
Orthofinder2鑒定單拷貝基因并構(gòu)建進(jìn)化樹
實(shí)驗(yàn)?zāi)康模罕容^基因組學(xué)，從基因組獲取單拷貝基因，并構(gòu)建有根的進(jìn)化樹，并估計(jì)分化時(shí)間，最終畫出有分化時(shí)間的進(jìn)化樹實(shí)驗(yàn)流程：orthofinder2獲取單拷貝基因——muscle...
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rgene_gamma計(jì)算2023-10-02rgene_gamma計(jì)算，準(zhǔn)備如下兩個(gè)文件，以及ctl配置文件 樹文件：請注意，根節(jié)點(diǎn)需要一個(gè)簡單的化石校準(zhǔn)，比如“@4.5”（450Ma ago）。如果沒有這個(gè)標(biāo)記計(jì)算出...
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個(gè)人博客: xuzhougeng.top (隨緣訪問)
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苦逼的科研狗<br>記性不好所以一些東西就寫下來加深印象，正好分享給一些需要的朋友
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簡言之，進(jìn)化為生命世界及其復(fù)雜性提供了符合邏輯的解釋
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你好，請問提取cds的時(shí)候報(bào)錯(cuò)，這種情況怎么辦呢？
No fasta index found for FF.fasta. Rebuilding, please wait..
Fasta index rebuilt.
生成的Epel.fasta.fai有什么用呢？之后cds要怎么提取嘞？謝謝gffread使用小妙招
大家好，今天給大家分享一個(gè)軟件(cufflinks)中的一個(gè)命令gffread，前一段時(shí)間需要提取生菜所有基因的CDS序列，本來一開始準(zhǔn)備自己寫腳本，后來發(fā)現(xiàn)gffread就...
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你好，請問提取cds的時(shí)候報(bào)錯(cuò)，這種情況怎么辦呢？
No fasta index found for FF.fasta. Rebuilding, please wait..
Fasta index rebuilt.2022-11-22教你如何使用gffread軟件
一、獲取軟件1、利用conda，簡單快捷 2、下載安裝這里用到了gffread (https://github.com/gpertea/gffread[https://git...
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博主您好 運(yùn)行腳本一之后 報(bào)錯(cuò)如下 之后要怎么辦呢？
Can't locate Bio/Root/RootI.pm in @INC (@INC contains: /usr/local/lib64/perl5 /usr/local/share/perl5 /usr/lib64/perl5/vendor_perl /usr/share/perl5/vendor_perl /usr/lib64/perl5 /usr/share/perl5 .) at bp_genebank2gff3.pl line 203.
BEGIN failed--compilation aborted at bp_genebank2gff3.pl line 203.【腳本搬運(yùn)工】convert gbff to gff/fasta
寫在前面從NCBI下載的注釋文件通常是gbff格式的，而我們平時(shí)做上游分析用到的大多數(shù)為gff或gtf文件，那么這兩種格式之間怎么進(jìn)行轉(zhuǎn)換呢。一番搜索后得到如下perl腳本。...
